Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PARP1P09874 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PARP1P09874 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PARP1P09874 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PARP1P09874 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP1P09874 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PARP1P09874 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PARP1P09874 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PARP1P09874 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PARP1P09874 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PARP1P09874 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PARP1P09874 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PARP1P09874 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PARP1P09874 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PARP1P09874 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PARP1P09874 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PARP1P09874 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PARP1P09874 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PARP1P09874 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PARP1P09874 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PARP1P09874 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PARP1P09874 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PARP1P09874 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PARP1P09874 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP1P09874 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP1P09874 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP1P09874 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP1P09874 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP1P09874 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP1P09874 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP1P09874 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP1P09874 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PARP1P09874 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PARP1P09874 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PARP1P09874 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PARP1P09874 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PARP1P09874 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PARP1P09874 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PARP1P09874 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PARP1P09874 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PARP1P09874 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PARP1P09874 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PARP1P09874 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP1P09874 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP1P09874 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP1P09874 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP1P09874 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP1P09874 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP1P09874 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP1P09874 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP1P09874 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP1P09874 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP1P09874 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PARP1P09874 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARP1P09874 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARP1P09874 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARP1P09874 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARP1P09874 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PARP1P09874 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PARP1P09874 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PARP1P09874 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PARP1P09874 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PARP1P09874 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PARP1P09874 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PARP1P09874 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARP1P09874 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARP1P09874 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARP1P09874 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PARP1P09874 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PARP1P09874 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PARP1P09874 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PARP1P09874 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PARP1P09874 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PARP1P09874 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PARP1P09874 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PARP1P09874 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PARP1P09874 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PARP1P09874 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PARP1P09874 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PARP1P09874 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PARP1P09874 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PARP1P09874 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PARP1P09874 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PARP1P09874 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PARP1P09874 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PARP1P09874 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PARP1P09874 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PARP1P09874 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PARP1P09874 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PARP1P09874 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PARP1P09874 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP1P09874 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP1P09874 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP1P09874 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP1P09874 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PARP1P09874 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PARP1P09874 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PARP1P09874 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PARP1P09874 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PARP1P09874 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms