Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA5P08648 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA5P08648 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA5P08648 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA5P08648 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms