Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APODP05090 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APODP05090 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APODP05090 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APODP05090 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APODP05090 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APODP05090 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APODP05090 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APODP05090 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APODP05090 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APODP05090 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APODP05090 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APODP05090 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APODP05090 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APODP05090 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APODP05090 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APODP05090 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
APODP05090 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APODP05090 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APODP05090 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APODP05090 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
APODP05090 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APODP05090 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APODP05090 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APODP05090 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APODP05090 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APODP05090 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APODP05090 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APODP05090 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APODP05090 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APODP05090 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
APODP05090 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APODP05090 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APODP05090 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APODP05090 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APODP05090 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APODP05090 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APODP05090 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APODP05090 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APODP05090 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APODP05090 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APODP05090 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APODP05090 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
APODP05090 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APODP05090 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APODP05090 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APODP05090 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
APODP05090 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APODP05090 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
APODP05090 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APODP05090 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APODP05090 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APODP05090 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APODP05090 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
APODP05090 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APODP05090 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APODP05090 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APODP05090 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APODP05090 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APODP05090 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
APODP05090 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
APODP05090 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APODP05090 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APODP05090 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APODP05090 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
APODP05090 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APODP05090 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APODP05090 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
APODP05090 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APODP05090 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APODP05090 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APODP05090 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APODP05090 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
APODP05090 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APODP05090 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
APODP05090 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APODP05090 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
APODP05090 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APODP05090 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APODP05090 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APODP05090 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APODP05090 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APODP05090 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APODP05090 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APODP05090 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APODP05090 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APODP05090 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APODP05090 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APODP05090 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APODP05090 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APODP05090 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APODP05090 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APODP05090 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APODP05090 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APODP05090 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APODP05090 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APODP05090 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APODP05090 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APODP05090 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APODP05090 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms