Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV3-15P01624 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGKV3-15P01624 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV3-15P01624 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IGKV3-15P01624 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
IGKV3-15P01624 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGKV3-15P01624 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGKV3-15P01624 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGKV3-15P01624 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGKV3-15P01624 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGKV3-15P01624 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGKV3-15P01624 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGKV3-15P01624 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGKV3-15P01624 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGKV3-15P01624 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGKV3-15P01624 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGKV3-15P01624 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGKV3-15P01624 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGKV3-15P01624 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGKV3-15P01624 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGKV3-15P01624 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGKV3-15P01624 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGKV3-15P01624 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGKV3-15P01624 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms