Protein–RNA interactions for Protein: P00441

SOD1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD1P00441 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOD1P00441 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOD1P00441 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOD1P00441 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOD1P00441 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOD1P00441 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SOD1P00441 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOD1P00441 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SOD1P00441 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOD1P00441 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOD1P00441 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOD1P00441 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOD1P00441 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOD1P00441 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOD1P00441 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOD1P00441 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOD1P00441 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOD1P00441 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOD1P00441 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOD1P00441 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOD1P00441 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOD1P00441 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOD1P00441 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOD1P00441 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOD1P00441 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOD1P00441 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOD1P00441 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOD1P00441 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOD1P00441 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOD1P00441 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOD1P00441 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOD1P00441 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOD1P00441 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOD1P00441 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOD1P00441 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SOD1P00441 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOD1P00441 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SOD1P00441 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOD1P00441 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOD1P00441 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOD1P00441 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOD1P00441 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOD1P00441 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SOD1P00441 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOD1P00441 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOD1P00441 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOD1P00441 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOD1P00441 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SOD1P00441 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOD1P00441 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOD1P00441 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOD1P00441 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOD1P00441 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOD1P00441 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SOD1P00441 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOD1P00441 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOD1P00441 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOD1P00441 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOD1P00441 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOD1P00441 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOD1P00441 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOD1P00441 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SOD1P00441 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOD1P00441 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOD1P00441 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOD1P00441 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOD1P00441 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOD1P00441 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOD1P00441 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOD1P00441 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOD1P00441 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOD1P00441 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOD1P00441 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOD1P00441 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOD1P00441 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOD1P00441 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOD1P00441 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOD1P00441 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOD1P00441 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOD1P00441 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOD1P00441 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOD1P00441 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOD1P00441 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOD1P00441 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOD1P00441 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOD1P00441 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOD1P00441 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOD1P00441 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOD1P00441 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOD1P00441 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOD1P00441 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOD1P00441 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOD1P00441 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOD1P00441 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SOD1P00441 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOD1P00441 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOD1P00441 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOD1P00441 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOD1P00441 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOD1P00441 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms