Protein–RNA interactions for Protein: P00439

PAH, Phenylalanine-4-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAHP00439 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAHP00439 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAHP00439 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PAHP00439 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAHP00439 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAHP00439 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAHP00439 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAHP00439 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAHP00439 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAHP00439 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAHP00439 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAHP00439 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAHP00439 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAHP00439 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAHP00439 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAHP00439 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAHP00439 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAHP00439 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PAHP00439 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAHP00439 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAHP00439 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAHP00439 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAHP00439 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAHP00439 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAHP00439 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAHP00439 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAHP00439 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAHP00439 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAHP00439 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PAHP00439 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAHP00439 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAHP00439 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAHP00439 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAHP00439 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAHP00439 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAHP00439 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAHP00439 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAHP00439 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAHP00439 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAHP00439 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAHP00439 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAHP00439 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PAHP00439 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PAHP00439 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAHP00439 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAHP00439 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAHP00439 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAHP00439 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAHP00439 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAHP00439 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAHP00439 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAHP00439 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAHP00439 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAHP00439 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAHP00439 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PAHP00439 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PAHP00439 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAHP00439 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAHP00439 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAHP00439 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAHP00439 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAHP00439 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAHP00439 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAHP00439 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAHP00439 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PAHP00439 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAHP00439 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAHP00439 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PAHP00439 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PAHP00439 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PAHP00439 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAHP00439 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAHP00439 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAHP00439 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAHP00439 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAHP00439 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAHP00439 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAHP00439 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAHP00439 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PAHP00439 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAHP00439 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAHP00439 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAHP00439 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAHP00439 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAHP00439 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAHP00439 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAHP00439 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAHP00439 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAHP00439 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAHP00439 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAHP00439 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAHP00439 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAHP00439 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAHP00439 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAHP00439 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAHP00439 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAHP00439 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAHP00439 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAHP00439 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAHP00439 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms