Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ZBED1O96006 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED1O96006 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED1O96006 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED1O96006 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED1O96006 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED1O96006 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED1O96006 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED1O96006 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED1O96006 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED1O96006 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED1O96006 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED1O96006 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED1O96006 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED1O96006 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED1O96006 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED1O96006 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED1O96006 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED1O96006 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED1O96006 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED1O96006 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED1O96006 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZBED1O96006 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED1O96006 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED1O96006 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZBED1O96006 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
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