Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PCNTO95613 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PCNTO95613 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PCNTO95613 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PCNTO95613 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PCNTO95613 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PCNTO95613 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PCNTO95613 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PCNTO95613 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
PCNTO95613 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PCNTO95613 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PCNTO95613 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PCNTO95613 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PCNTO95613 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCNTO95613 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCNTO95613 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PCNTO95613 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCNTO95613 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCNTO95613 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCNTO95613 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCNTO95613 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCNTO95613 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PCNTO95613 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCNTO95613 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCNTO95613 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCNTO95613 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCNTO95613 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCNTO95613 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCNTO95613 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCNTO95613 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PCNTO95613 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCNTO95613 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCNTO95613 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PCNTO95613 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PCNTO95613 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PCNTO95613 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PCNTO95613 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PCNTO95613 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PCNTO95613 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PCNTO95613 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PCNTO95613 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PCNTO95613 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PCNTO95613 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PCNTO95613 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PCNTO95613 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PCNTO95613 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PCNTO95613 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PCNTO95613 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCNTO95613 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCNTO95613 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCNTO95613 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCNTO95613 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCNTO95613 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCNTO95613 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCNTO95613 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCNTO95613 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCNTO95613 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCNTO95613 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCNTO95613 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCNTO95613 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCNTO95613 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCNTO95613 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCNTO95613 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCNTO95613 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PCNTO95613 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PCNTO95613 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PCNTO95613 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
PCNTO95613 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PCNTO95613 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PCNTO95613 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PCNTO95613 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCNTO95613 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCNTO95613 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PCNTO95613 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PCNTO95613 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCNTO95613 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCNTO95613 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCNTO95613 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCNTO95613 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCNTO95613 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCNTO95613 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCNTO95613 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PCNTO95613 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCNTO95613 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCNTO95613 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCNTO95613 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCNTO95613 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCNTO95613 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PCNTO95613 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCNTO95613 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCNTO95613 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCNTO95613 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCNTO95613 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCNTO95613 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCNTO95613 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCNTO95613 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCNTO95613 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCNTO95613 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCNTO95613 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCNTO95613 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms