Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PCNTO95613 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PCNTO95613 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PCNTO95613 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PCNTO95613 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PCNTO95613 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PCNTO95613 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PCNTO95613 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PCNTO95613 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
PCNTO95613 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PCNTO95613 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PCNTO95613 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PCNTO95613 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PCNTO95613 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCNTO95613 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCNTO95613 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PCNTO95613 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCNTO95613 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCNTO95613 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCNTO95613 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCNTO95613 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCNTO95613 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PCNTO95613 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCNTO95613 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCNTO95613 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCNTO95613 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCNTO95613 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCNTO95613 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCNTO95613 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCNTO95613 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PCNTO95613 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCNTO95613 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCNTO95613 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PCNTO95613 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PCNTO95613 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PCNTO95613 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PCNTO95613 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PCNTO95613 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PCNTO95613 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PCNTO95613 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PCNTO95613 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PCNTO95613 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PCNTO95613 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PCNTO95613 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PCNTO95613 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PCNTO95613 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PCNTO95613 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PCNTO95613 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCNTO95613 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCNTO95613 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCNTO95613 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCNTO95613 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCNTO95613 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCNTO95613 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCNTO95613 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCNTO95613 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCNTO95613 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCNTO95613 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCNTO95613 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCNTO95613 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCNTO95613 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCNTO95613 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCNTO95613 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCNTO95613 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PCNTO95613 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PCNTO95613 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PCNTO95613 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
PCNTO95613 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PCNTO95613 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PCNTO95613 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PCNTO95613 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCNTO95613 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCNTO95613 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PCNTO95613 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PCNTO95613 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCNTO95613 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCNTO95613 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCNTO95613 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCNTO95613 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCNTO95613 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCNTO95613 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCNTO95613 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PCNTO95613 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCNTO95613 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCNTO95613 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCNTO95613 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCNTO95613 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCNTO95613 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PCNTO95613 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCNTO95613 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCNTO95613 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCNTO95613 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCNTO95613 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCNTO95613 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCNTO95613 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCNTO95613 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCNTO95613 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCNTO95613 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCNTO95613 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCNTO95613 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms