Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
POLR1AO95602 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
POLR1AO95602 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
POLR1AO95602 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
POLR1AO95602 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
POLR1AO95602 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
POLR1AO95602 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
POLR1AO95602 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
POLR1AO95602 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
POLR1AO95602 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
POLR1AO95602 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
POLR1AO95602 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
POLR1AO95602 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
POLR1AO95602 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
POLR1AO95602 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
POLR1AO95602 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
POLR1AO95602 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
POLR1AO95602 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
POLR1AO95602 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
POLR1AO95602 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
POLR1AO95602 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
POLR1AO95602 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
POLR1AO95602 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.99■■■■□ 3.51
POLR1AO95602 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
POLR1AO95602 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
POLR1AO95602 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
POLR1AO95602 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
POLR1AO95602 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
POLR1AO95602 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
POLR1AO95602 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
POLR1AO95602 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
POLR1AO95602 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
POLR1AO95602 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
POLR1AO95602 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
POLR1AO95602 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
POLR1AO95602 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
POLR1AO95602 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.5
POLR1AO95602 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
POLR1AO95602 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
POLR1AO95602 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
POLR1AO95602 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
POLR1AO95602 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
POLR1AO95602 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
POLR1AO95602 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
POLR1AO95602 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
POLR1AO95602 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
POLR1AO95602 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
POLR1AO95602 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
POLR1AO95602 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
POLR1AO95602 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
POLR1AO95602 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
POLR1AO95602 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
POLR1AO95602 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
POLR1AO95602 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
POLR1AO95602 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
POLR1AO95602 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
POLR1AO95602 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
POLR1AO95602 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
POLR1AO95602 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
POLR1AO95602 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
POLR1AO95602 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
POLR1AO95602 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
POLR1AO95602 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
POLR1AO95602 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
POLR1AO95602 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
POLR1AO95602 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
POLR1AO95602 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
POLR1AO95602 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
POLR1AO95602 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
POLR1AO95602 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
POLR1AO95602 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
POLR1AO95602 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
POLR1AO95602 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
POLR1AO95602 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
POLR1AO95602 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms