Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN7O94888 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN7O94888 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN7O94888 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN7O94888 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN7O94888 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN7O94888 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN7O94888 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN7O94888 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN7O94888 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN7O94888 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN7O94888 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN7O94888 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBXN7O94888 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBXN7O94888 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBXN7O94888 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UBXN7O94888 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN7O94888 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBXN7O94888 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN7O94888 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN7O94888 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBXN7O94888 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBXN7O94888 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBXN7O94888 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBXN7O94888 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN7O94888 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN7O94888 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN7O94888 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBXN7O94888 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN7O94888 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBXN7O94888 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN7O94888 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBXN7O94888 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN7O94888 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN7O94888 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN7O94888 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN7O94888 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBXN7O94888 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN7O94888 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN7O94888 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN7O94888 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN7O94888 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBXN7O94888 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBXN7O94888 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN7O94888 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN7O94888 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBXN7O94888 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN7O94888 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms