Protein–RNA interactions for Protein: O60906

SMPD2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD2O60906 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD2O60906 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD2O60906 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD2O60906 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD2O60906 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD2O60906 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD2O60906 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMPD2O60906 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD2O60906 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD2O60906 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD2O60906 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD2O60906 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD2O60906 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD2O60906 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD2O60906 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD2O60906 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD2O60906 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD2O60906 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD2O60906 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD2O60906 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD2O60906 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD2O60906 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD2O60906 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD2O60906 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD2O60906 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMPD2O60906 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD2O60906 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD2O60906 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD2O60906 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD2O60906 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD2O60906 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD2O60906 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD2O60906 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD2O60906 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD2O60906 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD2O60906 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD2O60906 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD2O60906 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD2O60906 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD2O60906 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD2O60906 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD2O60906 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPD2O60906 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD2O60906 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPD2O60906 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms