Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMM17BO60830 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMM17BO60830 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMM17BO60830 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TIMM17BO60830 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM17BO60830 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TIMM17BO60830 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM17BO60830 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM17BO60830 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM17BO60830 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM17BO60830 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM17BO60830 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM17BO60830 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM17BO60830 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM17BO60830 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM17BO60830 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM17BO60830 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM17BO60830 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM17BO60830 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM17BO60830 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM17BO60830 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM17BO60830 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM17BO60830 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM17BO60830 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM17BO60830 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM17BO60830 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM17BO60830 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms