Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SELENOFO60613 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELENOFO60613 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOFO60613 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.2 ms