Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACSL4O60488 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACSL4O60488 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACSL4O60488 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACSL4O60488 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACSL4O60488 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACSL4O60488 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACSL4O60488 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACSL4O60488 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ACSL4O60488 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACSL4O60488 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ACSL4O60488 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACSL4O60488 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACSL4O60488 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACSL4O60488 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACSL4O60488 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACSL4O60488 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACSL4O60488 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ACSL4O60488 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACSL4O60488 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACSL4O60488 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACSL4O60488 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACSL4O60488 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACSL4O60488 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACSL4O60488 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ACSL4O60488 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACSL4O60488 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACSL4O60488 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACSL4O60488 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACSL4O60488 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACSL4O60488 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ACSL4O60488 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACSL4O60488 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACSL4O60488 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACSL4O60488 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACSL4O60488 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ACSL4O60488 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACSL4O60488 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ACSL4O60488 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ACSL4O60488 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACSL4O60488 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms