Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR2O43760 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SYNGR2O43760 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGR2O43760 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR2O43760 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms