Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC7A4O43246 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC7A4O43246 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC7A4O43246 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC7A4O43246 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms