Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDAC3O15379 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC3O15379 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC3O15379 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC3O15379 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC3O15379 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC3O15379 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC3O15379 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC3O15379 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC3O15379 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC3O15379 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC3O15379 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC3O15379 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC3O15379 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC3O15379 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC3O15379 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC3O15379 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC3O15379 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC3O15379 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC3O15379 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC3O15379 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC3O15379 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC3O15379 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC3O15379 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC3O15379 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC3O15379 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC3O15379 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms