Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
IFIT3O14879 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IFIT3O14879 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IFIT3O14879 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IFIT3O14879 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IFIT3O14879 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IFIT3O14879 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IFIT3O14879 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IFIT3O14879 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
IFIT3O14879 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
IFIT3O14879 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
IFIT3O14879 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IFIT3O14879 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
IFIT3O14879 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IFIT3O14879 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IFIT3O14879 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
IFIT3O14879 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IFIT3O14879 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IFIT3O14879 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IFIT3O14879 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IFIT3O14879 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IFIT3O14879 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
IFIT3O14879 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFIT3O14879 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IFIT3O14879 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFIT3O14879 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFIT3O14879 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFIT3O14879 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IFIT3O14879 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IFIT3O14879 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IFIT3O14879 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IFIT3O14879 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IFIT3O14879 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IFIT3O14879 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IFIT3O14879 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFIT3O14879 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFIT3O14879 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFIT3O14879 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IFIT3O14879 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IFIT3O14879 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IFIT3O14879 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
IFIT3O14879 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFIT3O14879 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IFIT3O14879 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IFIT3O14879 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IFIT3O14879 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IFIT3O14879 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFIT3O14879 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFIT3O14879 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFIT3O14879 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFIT3O14879 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFIT3O14879 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
IFIT3O14879 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFIT3O14879 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFIT3O14879 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFIT3O14879 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
IFIT3O14879 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFIT3O14879 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFIT3O14879 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFIT3O14879 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
IFIT3O14879 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFIT3O14879 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
IFIT3O14879 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
IFIT3O14879 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IFIT3O14879 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IFIT3O14879 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IFIT3O14879 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFIT3O14879 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFIT3O14879 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFIT3O14879 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFIT3O14879 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFIT3O14879 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFIT3O14879 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFIT3O14879 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFIT3O14879 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFIT3O14879 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFIT3O14879 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms