Protein–RNA interactions for Protein: O00574

CXCR6, C-X-C chemokine receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR6O00574 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR6O00574 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR6O00574 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CXCR6O00574 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR6O00574 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms