Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
AGRPO00253 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGRPO00253 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGRPO00253 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGRPO00253 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AGRPO00253 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGRPO00253 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGRPO00253 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGRPO00253 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGRPO00253 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGRPO00253 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGRPO00253 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGRPO00253 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGRPO00253 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGRPO00253 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGRPO00253 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGRPO00253 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGRPO00253 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGRPO00253 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGRPO00253 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGRPO00253 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGRPO00253 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AGRPO00253 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGRPO00253 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGRPO00253 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGRPO00253 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AGRPO00253 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGRPO00253 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGRPO00253 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGRPO00253 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGRPO00253 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGRPO00253 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGRPO00253 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGRPO00253 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGRPO00253 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGRPO00253 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGRPO00253 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGRPO00253 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGRPO00253 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGRPO00253 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGRPO00253 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGRPO00253 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGRPO00253 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGRPO00253 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGRPO00253 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGRPO00253 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGRPO00253 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGRPO00253 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGRPO00253 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGRPO00253 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGRPO00253 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGRPO00253 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGRPO00253 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGRPO00253 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGRPO00253 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGRPO00253 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGRPO00253 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGRPO00253 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGRPO00253 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGRPO00253 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGRPO00253 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGRPO00253 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGRPO00253 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGRPO00253 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGRPO00253 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AGRPO00253 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGRPO00253 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGRPO00253 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGRPO00253 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGRPO00253 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGRPO00253 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AGRPO00253 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGRPO00253 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGRPO00253 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGRPO00253 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGRPO00253 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGRPO00253 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGRPO00253 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGRPO00253 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGRPO00253 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGRPO00253 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGRPO00253 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGRPO00253 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGRPO00253 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGRPO00253 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGRPO00253 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGRPO00253 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGRPO00253 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGRPO00253 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AGRPO00253 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AGRPO00253 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGRPO00253 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AGRPO00253 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGRPO00253 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGRPO00253 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGRPO00253 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGRPO00253 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGRPO00253 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGRPO00253 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGRPO00253 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms