Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3QLW9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3QLW9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3QLW9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3QLW9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3QLW9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3QLW9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QLW9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3QLW9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
J3QLW9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3QLW9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3QLW9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3QLW9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3QLW9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3QLW9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
J3QLW9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3QLW9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3QLW9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
J3QLW9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QLW9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QLW9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QLW9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QLW9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QLW9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QLW9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3QLW9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3QLW9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3QLW9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3QLW9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3QLW9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3QLW9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3QLW9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3QLW9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3QLW9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3QLW9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3QLW9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3QLW9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QLW9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QLW9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QLW9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QLW9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QLW9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QLW9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QLW9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QLW9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QLW9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QLW9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
J3QLW9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3QLW9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3QLW9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3QLW9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3QLW9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3QLW9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
J3QLW9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
J3QLW9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3QLW9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3QLW9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3QLW9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3QLW9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3QLW9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3QLW9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3QLW9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
J3QLW9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3QLW9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3QLW9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3QLW9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
J3QLW9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3QLW9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3QLW9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3QLW9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3QLW9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3QLW9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3QLW9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QLW9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QLW9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QLW9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QLW9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QLW9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QLW9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QLW9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QLW9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QLW9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QLW9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QLW9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QLW9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
J3QLW9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3QLW9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3QLW9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3QLW9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3QLW9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3QLW9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3QLW9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3QLW9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QLW9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QLW9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QLW9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QLW9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QLW9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QLW9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QLW9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms