Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM227AF5H4B4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM227AF5H4B4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM227AF5H4B4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227AF5H4B4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM227AF5H4B4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM227AF5H4B4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM227AF5H4B4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM227AF5H4B4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM227AF5H4B4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM227AF5H4B4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM227AF5H4B4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM227AF5H4B4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM227AF5H4B4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227AF5H4B4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227AF5H4B4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227AF5H4B4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227AF5H4B4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227AF5H4B4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227AF5H4B4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM227AF5H4B4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM227AF5H4B4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM227AF5H4B4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM227AF5H4B4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM227AF5H4B4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM227AF5H4B4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227AF5H4B4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227AF5H4B4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227AF5H4B4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM227AF5H4B4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227AF5H4B4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227AF5H4B4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227AF5H4B4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM227AF5H4B4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227AF5H4B4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227AF5H4B4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227AF5H4B4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227AF5H4B4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227AF5H4B4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227AF5H4B4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM227AF5H4B4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM227AF5H4B4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM227AF5H4B4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM227AF5H4B4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227AF5H4B4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227AF5H4B4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227AF5H4B4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM227AF5H4B4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM227AF5H4B4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms