Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BHMG1C9JSJ3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BHMG1C9JSJ3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BHMG1C9JSJ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BHMG1C9JSJ3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
BHMG1C9JSJ3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
BHMG1C9JSJ3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BHMG1C9JSJ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BHMG1C9JSJ3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BHMG1C9JSJ3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BHMG1C9JSJ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BHMG1C9JSJ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BHMG1C9JSJ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BHMG1C9JSJ3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BHMG1C9JSJ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BHMG1C9JSJ3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BHMG1C9JSJ3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BHMG1C9JSJ3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BHMG1C9JSJ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BHMG1C9JSJ3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BHMG1C9JSJ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BHMG1C9JSJ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BHMG1C9JSJ3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms