Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC182A6NF36 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC182A6NF36 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC182A6NF36 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms