Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YX94

PNMA6F, Paraneoplastic antigen Ma6F, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6FA0A0J9YX94 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PNMA6FA0A0J9YX94 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PNMA6FA0A0J9YX94 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PNMA6FA0A0J9YX94 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PNMA6FA0A0J9YX94 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PNMA6FA0A0J9YX94 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PNMA6FA0A0J9YX94 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PNMA6FA0A0J9YX94 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PNMA6FA0A0J9YX94 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PNMA6FA0A0J9YX94 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PNMA6FA0A0J9YX94 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PNMA6FA0A0J9YX94 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PNMA6FA0A0J9YX94 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PNMA6FA0A0J9YX94 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PNMA6FA0A0J9YX94 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PNMA6FA0A0J9YX94 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PNMA6FA0A0J9YX94 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PNMA6FA0A0J9YX94 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PNMA6FA0A0J9YX94 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PNMA6FA0A0J9YX94 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PNMA6FA0A0J9YX94 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PNMA6FA0A0J9YX94 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PNMA6FA0A0J9YX94 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PNMA6FA0A0J9YX94 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PNMA6FA0A0J9YX94 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PNMA6FA0A0J9YX94 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PNMA6FA0A0J9YX94 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PNMA6FA0A0J9YX94 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PNMA6FA0A0J9YX94 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PNMA6FA0A0J9YX94 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PNMA6FA0A0J9YX94 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PNMA6FA0A0J9YX94 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PNMA6FA0A0J9YX94 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PNMA6FA0A0J9YX94 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PNMA6FA0A0J9YX94 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PNMA6FA0A0J9YX94 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PNMA6FA0A0J9YX94 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PNMA6FA0A0J9YX94 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PNMA6FA0A0J9YX94 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PNMA6FA0A0J9YX94 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PNMA6FA0A0J9YX94 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PNMA6FA0A0J9YX94 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PNMA6FA0A0J9YX94 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PNMA6FA0A0J9YX94 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PNMA6FA0A0J9YX94 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PNMA6FA0A0J9YX94 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PNMA6FA0A0J9YX94 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PNMA6FA0A0J9YX94 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PNMA6FA0A0J9YX94 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PNMA6FA0A0J9YX94 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PNMA6FA0A0J9YX94 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PNMA6FA0A0J9YX94 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PNMA6FA0A0J9YX94 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PNMA6FA0A0J9YX94 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PNMA6FA0A0J9YX94 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PNMA6FA0A0J9YX94 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PNMA6FA0A0J9YX94 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PNMA6FA0A0J9YX94 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PNMA6FA0A0J9YX94 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PNMA6FA0A0J9YX94 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PNMA6FA0A0J9YX94 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PNMA6FA0A0J9YX94 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PNMA6FA0A0J9YX94 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PNMA6FA0A0J9YX94 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNMA6FA0A0J9YX94 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNMA6FA0A0J9YX94 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNMA6FA0A0J9YX94 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNMA6FA0A0J9YX94 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNMA6FA0A0J9YX94 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNMA6FA0A0J9YX94 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PNMA6FA0A0J9YX94 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms