Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0T9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0T9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A087X0T9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A087X0T9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A087X0T9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms