Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUU8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUU8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A087WUU8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A087WUU8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A087WUU8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A087WUU8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A087WUU8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A087WUU8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A087WUU8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A087WUU8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A087WUU8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A087WUU8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A087WUU8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A087WUU8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A087WUU8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A087WUU8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A087WUU8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WUU8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WUU8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WUU8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WUU8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A087WUU8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms