RNA–Protein interactions for RNA: YKL209C

STE6, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene STE6, Length 3,873 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STE6	YKL209C	INO80	P53115	1489 aa		5.92	□□□□□ -1.46
STE6	YKL209C	MTC1	P47018	478 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
STE6	YKL209C	RSE1	Q04693	1361 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
STE6	YKL209C	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
STE6	YKL209C	RQC2	Q12532	1038 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
STE6	YKL209C	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		5.4	□□□□□ -1.54
STE6	YKL209C	DNA2	P38859	1522 aa		5.38	□□□□□ -1.55
STE6	YKL209C	SWR1	Q05471	1514 aa		5.38	□□□□□ -1.55
STE6	YKL209C	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
STE6	YKL209C	SGS1	P35187	1447 aa		5.36	□□□□□ -1.55
STE6	YKL209C	KOG1	P38873	1557 aa		5.26	□□□□□ -1.57
STE6	YKL209C	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
STE6	YKL209C	ECM5	Q03214	1411 aa		5.22	□□□□□ -1.57
STE6	YKL209C	DRS1	P32892	752 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
STE6	YKL209C	TAF2	P23255	1407 aa		5.15	□□□□□ -1.58
STE6	YKL209C	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
STE6	YKL209C	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
STE6	YKL209C	HSL1	P34244	1518 aa		5.11	□□□□□ -1.59
STE6	YKL209C	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
STE6	YKL209C	MIF2	P35201	549 aa		5.07	□□□□□ -1.6
STE6	YKL209C	BUD4	P47136	1447 aa		5.05	□□□□□ -1.6
STE6	YKL209C	HIR3	P47171	1648 aa		5	□□□□□ -1.61
STE6	YKL209C	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
STE6	YKL209C	RTT106	P40161	455 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STE6	YKL209C	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STE6	YKL209C	PEP1	P32319	1579 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STE6	YKL209C	YFR006W	P43590	535 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STE6	YKL209C	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STE6	YKL209C	ATG2	P53855	1592 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STE6	YKL209C	MDS3	P53094	1487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STE6	YKL209C	IFH1	P39520	1085 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STE6	YKL209C	ITT1	Q04638	464 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STE6	YKL209C	REV3	P14284	1504 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STE6	YKL209C	BPT1	P14772	1559 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STE6	YKL209C	SSN2	P38931	1420 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STE6	YKL209C	UFD4	P33202	1483 aa		4.81	□□□□□ -1.64
STE6	YKL209C	CKB1	P43639	278 aa		4.78	□□□□□ -1.64
STE6	YKL209C	TAF7	Q05021	590 aa		4.78	□□□□□ -1.64
STE6	YKL209C	MET10	P39692	1035 aa		4.77	□□□□□ -1.65
STE6	YKL209C	TRM732	Q03496	1420 aa		4.77	□□□□□ -1.65
STE6	YKL209C	DRS2	P39524	1355 aa		4.77	□□□□□ -1.65
STE6	YKL209C	MMS1	Q06211	1407 aa		4.74	□□□□□ -1.65
STE6	YKL209C	SSK2	P53599	1579 aa		4.73	□□□□□ -1.65
STE6	YKL209C	SIN3	P22579	1536 aa		4.73	□□□□□ -1.65
STE6	YKL209C	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		4.72	□□□□□ -1.65
STE6	YKL209C	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.72	□□□□□ -1.65
STE6	YKL209C	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.72	□□□□□ -1.65
STE6	YKL209C	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.72	□□□□□ -1.65
STE6	YKL209C	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		4.72	□□□□□ -1.65
STE6	YKL209C	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.72	□□□□□ -1.65
STE6	YKL209C	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
STE6	YKL209C	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		4.72	□□□□□ -1.65
STE6	YKL209C	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		4.72	□□□□□ -1.65
STE6	YKL209C	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		4.72	□□□□□ -1.65
STE6	YKL209C	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
STE6	YKL209C	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
STE6	YKL209C	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STE6	YKL209C	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STE6	YKL209C	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STE6	YKL209C	ESP1	Q03018	1630 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STE6	YKL209C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
STE6	YKL209C	LTE1	P07866	1435 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STE6	YKL209C	STH1	P32597	1359 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STE6	YKL209C	CHD1	P32657	1468 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STE6	YKL209C	TY2B-B	Q12491	1770 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STE6	YKL209C	MET5	P47169	1442 aa		4.65	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	TY1B-H	O13535	1793 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	DNF1	P32660	1571 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	YTA7	P40340	1379 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	YAP3	P38749	330 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	BNI1	P41832	1953 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	MRX12	P47084	519 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	PAN1	P32521	1480 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	YPK9	Q12697	1472 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	MMS22	Q06164	1454 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STE6	YKL209C	SCC2	Q04002	1493 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STE6	YKL209C	LEU3	P08638	886 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STE6	YKL209C	SPP41	P38904	1435 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STE6	YKL209C	NUP159	P40477	1460 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STE6	YKL209C	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STE6	YKL209C	CDC25	P04821	1589 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STE6	YKL209C	PAF1	P38351	445 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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