RNA–Protein interactions for RNA: YHR049C-A

YHR049C-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YHR049C-A, Length 297 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR049C-AYHR049C-A SGS1P35187 1447 aa24.29■■□□□ 1.48
YHR049C-AYHR049C-A INO80P53115 1489 aa23.91■■□□□ 1.42
YHR049C-AYHR049C-A SPA2P23201 1466 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
YHR049C-AYHR049C-A TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
YHR049C-AYHR049C-A SSN2P38931 1420 aa23.35■■□□□ 1.33
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-DR4Q07793 1604 aa23.29■■□□□ 1.32
YHR049C-AYHR049C-A MON2P48563 1636 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
YHR049C-AYHR049C-A HSL1P34244 1518 aa22.85■■□□□ 1.25
YHR049C-AYHR049C-A SPT6P23615 1451 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
YHR049C-AYHR049C-A SWR1Q05471 1514 aa22.59■■□□□ 1.21
YHR049C-AYHR049C-A DRS1P32892 752 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
YHR049C-AYHR049C-A HIR3P47171 1648 aa22.43■■□□□ 1.18
YHR049C-AYHR049C-A XRN1P22147 1528 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
YHR049C-AYHR049C-A REV3P14284 1504 aa22.03■■□□□ 1.12
YHR049C-AYHR049C-A SIN3P22579 1536 aa21.96■■□□□ 1.11
YHR049C-AYHR049C-A THO2P53552 1597 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
YHR049C-AYHR049C-A SSK2P53599 1579 aa21.82■■□□□ 1.08
YHR049C-AYHR049C-A KOG1P38873 1557 aa21.78■■□□□ 1.08
YHR049C-AYHR049C-A DNA2P38859 1522 aa21.76■■□□□ 1.07
YHR049C-AYHR049C-A ESP1Q03018 1630 aa21.62■■□□□ 1.05
YHR049C-AYHR049C-A MYO2P19524 1574 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
YHR049C-AYHR049C-A TAF2P23255 1407 aa21.55■■□□□ 1.04
YHR049C-AYHR049C-A BUD4P47136 1447 aa21.52■■□□□ 1.04
YHR049C-AYHR049C-A ATG2P53855 1592 aa21.48■■□□□ 1.03
YHR049C-AYHR049C-A ECM5Q03214 1411 aa21.32■■□□□ 1
YHR049C-AYHR049C-A YPK9Q12697 1472 aa21.23■□□□□ 0.99
YHR049C-AYHR049C-A PEP1P32319 1579 aa21.23■□□□□ 0.99
YHR049C-AYHR049C-A CHD1P32657 1468 aa21.2■□□□□ 0.98
YHR049C-AYHR049C-A POL1P13382 1468 aa21.2■□□□□ 0.98
YHR049C-AYHR049C-A SKI3P17883 1432 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
YHR049C-AYHR049C-A MDS3P53094 1487 aa21.18■□□□□ 0.98
YHR049C-AYHR049C-A MMS22Q06164 1454 aa21.08■□□□□ 0.97
YHR049C-AYHR049C-A STU1P38198 1513 aa21.06■□□□□ 0.96
YHR049C-AYHR049C-A SCC2Q04002 1493 aa21.02■□□□□ 0.96
YHR049C-AYHR049C-A RKR1Q04781 1562 aa20.96■□□□□ 0.95
YHR049C-AYHR049C-A RPO31P04051 1460 aa20.9■□□□□ 0.94
YHR049C-AYHR049C-A YOR1P53049 1477 aa20.87■□□□□ 0.93
YHR049C-AYHR049C-A YTA7P40340 1379 aa20.86■□□□□ 0.93
YHR049C-AYHR049C-A BPT1P14772 1559 aa20.85■□□□□ 0.93
YHR049C-AYHR049C-A TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa20.77■□□□□ 0.91
YHR049C-AYHR049C-A TY2B-FP0CX63 1770 aa20.77■□□□□ 0.91
YHR049C-AYHR049C-A TY2B-GR2P0CX64 1770 aa20.77■□□□□ 0.91
YHR049C-AYHR049C-A TY2B-CP25384 1770 aa20.77■□□□□ 0.91
YHR049C-AYHR049C-A TY2B-DR2Q03494 1770 aa20.77■□□□□ 0.91
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-DR1Q03855 1755 aa20.77■□□□□ 0.91
YHR049C-AYHR049C-A TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
YHR049C-AYHR049C-A TY2B-OR1Q12113 1770 aa20.77■□□□□ 0.91
YHR049C-AYHR049C-A TY2B-DR1Q12472 1770 aa20.77■□□□□ 0.91
YHR049C-AYHR049C-A TY2B-OR2Q12501 1770 aa20.77■□□□□ 0.91
YHR049C-AYHR049C-A YCF1P39109 1515 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
YHR049C-AYHR049C-A MYO4P32492 1471 aa20.75■□□□□ 0.91
YHR049C-AYHR049C-A TOP2P06786 1428 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
YHR049C-AYHR049C-A UFD4P33202 1483 aa20.73■□□□□ 0.91
YHR049C-AYHR049C-A SMC4Q12267 1418 aa20.7■□□□□ 0.9
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-DR3Q99231 1755 aa20.69■□□□□ 0.9
YHR049C-AYHR049C-A RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
YHR049C-AYHR049C-A TY2B-BQ12491 1770 aa20.59■□□□□ 0.89
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-HO13535 1793 aa20.44■□□□□ 0.86
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa20.44■□□□□ 0.86
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa20.44■□□□□ 0.86
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa20.44■□□□□ 0.86
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa20.44■□□□□ 0.86
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-JR1P47098 1755 aa20.44■□□□□ 0.86
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-ER1Q03612 1755 aa20.44■□□□□ 0.86
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-GR2Q12269 1755 aa20.44■□□□□ 0.86
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-OLQ12273 1755 aa20.44■□□□□ 0.86
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
YHR049C-AYHR049C-A SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-BRQ12193 1756 aa20.43■□□□□ 0.86
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-GR3Q12316 1755 aa20.43■□□□□ 0.86
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-ORQ92393 1755 aa20.43■□□□□ 0.86
YHR049C-AYHR049C-A SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
YHR049C-AYHR049C-A MLP2P40457 1679 aa20.38■□□□□ 0.85
YHR049C-AYHR049C-A TRM732Q03496 1420 aa20.28■□□□□ 0.84
YHR049C-AYHR049C-A SPP41P38904 1435 aa20.26■□□□□ 0.83
YHR049C-AYHR049C-A CDC25P04821 1589 aa20.25■□□□□ 0.83
YHR049C-AYHR049C-A STH1P32597 1359 aa20.24■□□□□ 0.83
YHR049C-AYHR049C-A PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
YHR049C-AYHR049C-A ULS1Q08562 1619 aa20.21■□□□□ 0.83
YHR049C-AYHR049C-A TAF7Q05021 590 aa20.21■□□□□ 0.83
YHR049C-AYHR049C-A VTH1P40438 1549 aa20.17■□□□□ 0.82
YHR049C-AYHR049C-A VTH2P40890 1549 aa20.17■□□□□ 0.82
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-ER2Q03619 1755 aa20.11■□□□□ 0.81
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-MR1Q04214 1755 aa20.11■□□□□ 0.81
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-NL1Q12112 1755 aa20.11■□□□□ 0.81
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-GR1Q12141 1755 aa20.11■□□□□ 0.81
YHR049C-AYHR049C-A TY1B-BLQ12490 1755 aa20.11■□□□□ 0.81
YHR049C-AYHR049C-A TSC11P40061 1430 aa20.1■□□□□ 0.81
YHR049C-AYHR049C-A NUP170P38181 1502 aa20.09■□□□□ 0.81
YHR049C-AYHR049C-A PAN1P32521 1480 aa20.09■□□□□ 0.81
YHR049C-AYHR049C-A IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
YHR049C-AYHR049C-A ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.3 ms