RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	MTC1	P47018	478 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.04
SYF2	YGR129W	DRS1	P32892	752 aa	Known RBP	14.18	□□□□□ -0.14
SYF2	YGR129W	FAP1	P53971	965 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SYF2	YGR129W	INO80	P53115	1489 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SYF2	YGR129W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SYF2	YGR129W	PRY3	P47033	881 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SYF2	YGR129W	PRI1	P10363	409 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SYF2	YGR129W	AAD16	Q02895	342 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SYF2	YGR129W	ISW2	Q08773	1120 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SYF2	YGR129W	DNA2	P38859	1522 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SYF2	YGR129W	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
SYF2	YGR129W	SWR1	Q05471	1514 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SYF2	YGR129W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
SYF2	YGR129W	KOG1	P38873	1557 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SYF2	YGR129W	RSE1	Q04693	1361 aa	Known RBP	12.38	□□□□□ -0.43
SYF2	YGR129W	YCK3	P39962	524 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SYF2	YGR129W	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	12.23	□□□□□ -0.45
SYF2	YGR129W	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	12.22	□□□□□ -0.45
SYF2	YGR129W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SYF2	YGR129W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.46
SYF2	YGR129W	AVT3	P36062	692 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SYF2	YGR129W	SGS1	P35187	1447 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SYF2	YGR129W	MRPL32	P25348	183 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SYF2	YGR129W	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SYF2	YGR129W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SYF2	YGR129W	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SYF2	YGR129W	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SYF2	YGR129W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SYF2	YGR129W	HSL1	P34244	1518 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SYF2	YGR129W	REB1	P21538	810 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SYF2	YGR129W	ECM5	Q03214	1411 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SYF2	YGR129W	BUD4	P47136	1447 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SYF2	YGR129W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
SYF2	YGR129W	HIR3	P47171	1648 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SYF2	YGR129W	MDS3	P53094	1487 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SYF2	YGR129W	REV3	P14284	1504 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SYF2	YGR129W	YGL015C	P33199	130 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SYF2	YGR129W	PEP1	P32319	1579 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SYF2	YGR129W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SYF2	YGR129W	SPT21	P35209	758 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SYF2	YGR129W	BPT1	P14772	1559 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SYF2	YGR129W	CDC27	P38042	758 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SYF2	YGR129W	ATG2	P53855	1592 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SYF2	YGR129W	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SYF2	YGR129W	MIF2	P35201	549 aa		10.93	□□□□□ -0.66
SYF2	YGR129W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	10.92	□□□□□ -0.66
SYF2	YGR129W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
SYF2	YGR129W	HO	P09932	586 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SYF2	YGR129W	SSK2	P53599	1579 aa		10.85	□□□□□ -0.67
SYF2	YGR129W	TAF2	P23255	1407 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SYF2	YGR129W	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
SYF2	YGR129W	TFC8	Q12308	588 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SYF2	YGR129W	DCD1	P06773	312 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SYF2	YGR129W	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SYF2	YGR129W	SIN3	P22579	1536 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SYF2	YGR129W	RIM101	P33400	625 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SYF2	YGR129W	UFD4	P33202	1483 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SYF2	YGR129W	SSN2	P38931	1420 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SYF2	YGR129W	MET5	P47169	1442 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SYF2	YGR129W	ESP1	Q03018	1630 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SYF2	YGR129W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SYF2	YGR129W	LTE1	P07866	1435 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SYF2	YGR129W	DNF1	P32660	1571 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SYF2	YGR129W	SCY1	P53009	804 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SYF2	YGR129W	CHD1	P32657	1468 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SYF2	YGR129W	CDC25	P04821	1589 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SYF2	YGR129W	BNI1	P41832	1953 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SYF2	YGR129W	SCC2	Q04002	1493 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SYF2	YGR129W	YFR006W	P43590	535 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SYF2	YGR129W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	10.56	□□□□□ -0.72
SYF2	YGR129W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	10.53	□□□□□ -0.72
SYF2	YGR129W	YPK9	Q12697	1472 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SYF2	YGR129W	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SYF2	YGR129W	ITT1	Q04638	464 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SYF2	YGR129W	RQC2	Q12532	1038 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SYF2	YGR129W	RPO31	P04051	1460 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SYF2	YGR129W	RKR1	Q04781	1562 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SYF2	YGR129W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SYF2	YGR129W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SYF2	YGR129W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SYF2	YGR129W	BCH2	P36122	765 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SYF2	YGR129W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SYF2	YGR129W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SYF2	YGR129W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SYF2	YGR129W	TY2B-C	P25384	1770 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SYF2	YGR129W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SYF2	YGR129W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SYF2	YGR129W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
SYF2	YGR129W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SYF2	YGR129W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SYF2	YGR129W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SYF2	YGR129W	PAN1	P32521	1480 aa		10.46	□□□□□ -0.74
SYF2	YGR129W	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
SYF2	YGR129W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SYF2	YGR129W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SYF2	YGR129W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
SYF2	YGR129W	OXP1	P28273	1286 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SYF2	YGR129W	MMS1	Q06211	1407 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SYF2	YGR129W	TY1B-H	O13535	1793 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SYF2	YGR129W	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		10.34	□□□□□ -0.75

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