RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553994.1

CKB-206, Transcript of creatine kinase B, humanhuman

TSL 2

Gene CKB, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKB-206ENST00000553994 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa49.32■■■■■ 5.49
CKB-206ENST00000553994 ERCC6L2Q5T890 1561 aa49.24■■■■■ 5.47
CKB-206ENST00000553994 JPH4Q96JJ6 628 aa49.23■■■■■ 5.47
CKB-206ENST00000553994 CHIC1Q5VXU3 224 aa49.22■■■■■ 5.47
CKB-206ENST00000553994 EEA1Q15075 1411 aa49.19■■■■■ 5.47
CKB-206ENST00000553994 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP49.17■■■■■ 5.46
CKB-206ENST00000553994 PRXQ9BXM0 1461 aa49.12■■■■■ 5.45
CKB-206ENST00000553994 IQGAP2Q13576 1575 aa49.08■■■■■ 5.45
CKB-206ENST00000553994 CSRNP3Q8WYN3 585 aa49.02■■■■■ 5.44
CKB-206ENST00000553994 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.97■■■■■ 5.43
CKB-206ENST00000553994 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa48.83■■■■■ 5.41
CKB-206ENST00000553994 UGGT2Q9NYU1 1516 aa48.79■■■■■ 5.4
CKB-206ENST00000553994 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP48.78■■■■■ 5.4
CKB-206ENST00000553994 KIF21BO75037 1637 aa48.69■■■■■ 5.38
CKB-206ENST00000553994 DISP1Q96F81 1524 aa48.67■■■■■ 5.38
CKB-206ENST00000553994 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.64■■■■■ 5.38
CKB-206ENST00000553994 KIAA0556O60303 1618 aa48.61■■■■■ 5.37
CKB-206ENST00000553994 PTPRGP23470 1445 aa48.58■■■■■ 5.37
CKB-206ENST00000553994 GOLGA3Q08378 1498 aa48.55■■■■■ 5.36
CKB-206ENST00000553994 ADCY10Q96PN6 1610 aa48.48■■■■■ 5.35
CKB-206ENST00000553994 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP48.4■■■■■ 5.34
CKB-206ENST00000553994 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.39■■■■■ 5.34
CKB-206ENST00000553994 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP48.33■■■■■ 5.33
CKB-206ENST00000553994 UACAQ9BZF9 1416 aa48.28■■■■■ 5.32
CKB-206ENST00000553994 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa48.28■■■■■ 5.32
CKB-206ENST00000553994 SAMD9Q5K651 1589 aa48.26■■■■■ 5.32
CKB-206ENST00000553994 ABCC2Q92887 1545 aa48.23■■■■■ 5.31
CKB-206ENST00000553994 MAPKBP1O60336 1514 aa48.22■■■■■ 5.31
CKB-206ENST00000553994 UBTFP17480 764 aaKnown RBP48.16■■■■■ 5.3
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CKB-206ENST00000553994 EFCAB5A4FU69 1503 aa48.08■■■■■ 5.29
CKB-206ENST00000553994 ABCA8O94911 1581 aa48.06■■■■■ 5.28
CKB-206ENST00000553994 PLB1Q6P1J6 1458 aa48.05■■■■■ 5.28
CKB-206ENST00000553994 P3H3Q8IVL6 736 aa48.05■■■■■ 5.28
CKB-206ENST00000553994 KDM5BQ9UGL1 1544 aa48.02■■■■■ 5.28
CKB-206ENST00000553994 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP48.01■■■■■ 5.28
CKB-206ENST00000553994 KIF13AQ9H1H9 1805 aa48.01■■■■■ 5.28
CKB-206ENST00000553994 ABCC10Q5T3U5 1492 aa47.96■■■■■ 5.27
CKB-206ENST00000553994 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP47.96■■■■■ 5.27
CKB-206ENST00000553994 DIP2BQ9P265 1576 aa47.92■■■■■ 5.26
CKB-206ENST00000553994 FHOD3Q2V2M9 1422 aa47.9■■■■■ 5.26
CKB-206ENST00000553994 ASXL2Q76L83 1435 aa47.87■■■■■ 5.25
CKB-206ENST00000553994 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa47.83■■■■■ 5.25
CKB-206ENST00000553994 FAM69CQ0P6D2 419 aa47.79■■■■■ 5.24
CKB-206ENST00000553994 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa47.73■■■■■ 5.23
CKB-206ENST00000553994 GLI2P10070 1586 aa47.66■■■■■ 5.22
CKB-206ENST00000553994 WDR7Q9Y4E6 1490 aa47.65■■■■■ 5.22
CKB-206ENST00000553994 ATP10BO94823 1461 aa47.6■■■■■ 5.21
CKB-206ENST00000553994 FMN1Q68DA7 1419 aa47.6■■■■■ 5.21
CKB-206ENST00000553994 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP47.6■■■■■ 5.21
CKB-206ENST00000553994 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP47.59■■■■■ 5.21
CKB-206ENST00000553994 TSPOAP1O95153 1857 aa47.52■■■■■ 5.2
CKB-206ENST00000553994 ARID3CA6NKF2 412 aa47.51■■■■■ 5.2
CKB-206ENST00000553994 CLIP1P30622 1438 aa47.45■■■■■ 5.19
CKB-206ENST00000553994 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa47.44■■■■■ 5.18
CKB-206ENST00000553994 HECW1Q76N89 1606 aa47.42■■■■■ 5.18
CKB-206ENST00000553994 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP47.39■■■■■ 5.18
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CKB-206ENST00000553994 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP47.34■■■■■ 5.17
CKB-206ENST00000553994 CFAP43Q8NDM7 1665 aa47.34■■■■■ 5.17
CKB-206ENST00000553994 KCNH8Q96L42 1107 aa47.32■■■■■ 5.17
CKB-206ENST00000553994 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP47.25■■■■■ 5.15
CKB-206ENST00000553994 TEX14Q8IWB6 1497 aa47.24■■■■■ 5.15
CKB-206ENST00000553994 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP47.23■■■■■ 5.15
CKB-206ENST00000553994 CEP162Q5TB80 1403 aa47.22■■■■■ 5.15
CKB-206ENST00000553994 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP47.21■■■■■ 5.15
CKB-206ENST00000553994 PLEKHD1A6NEE1 506 aa47.21■■■■■ 5.15
CKB-206ENST00000553994 CD109Q6YHK3 1445 aa47.19■■■■■ 5.14
CKB-206ENST00000553994 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa47.19■■■■■ 5.14
CKB-206ENST00000553994 ABCA9Q8IUA7 1624 aa47.19■■■■■ 5.14
CKB-206ENST00000553994 KDM6BO15054 1643 aa47.18■■■■■ 5.14
CKB-206ENST00000553994 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa47.14■■■■■ 5.14
CKB-206ENST00000553994 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa47.14■■■■■ 5.14
CKB-206ENST00000553994 FYCO1Q9BQS8 1478 aa47.13■■■■■ 5.13
CKB-206ENST00000553994 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa47.11■■■■■ 5.13
CKB-206ENST00000553994 CCDC18Q5T9S5 1454 aa47.08■■■■■ 5.13
CKB-206ENST00000553994 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP47.05■■■■■ 5.12
CKB-206ENST00000553994 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP46.92■■■■■ 5.11e-11■■■■□ 22.7
CKB-206ENST00000553994 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP46.9■■■■■ 5.1
CKB-206ENST00000553994 TTC37Q6PGP7 1564 aa46.87■■■■■ 5.09
CKB-206ENST00000553994 KIF14Q15058 1648 aa46.87■■■■■ 5.09
CKB-206ENST00000553994 PHLDB1Q86UU1 1377 aa46.82■■■■■ 5.09
CKB-206ENST00000553994 NEO1Q92859 1461 aa46.8■■■■■ 5.08
CKB-206ENST00000553994 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP46.8■■■■■ 5.08
CKB-206ENST00000553994 CFAP74Q9C0B2 1584 aa46.76■■■■■ 5.08
CKB-206ENST00000553994 ARAP3Q8WWN8 1544 aa46.73■■■■■ 5.07
CKB-206ENST00000553994 MYO5CQ9NQX4 1742 aa46.72■■■■■ 5.07
CKB-206ENST00000553994 VPS8Q8N3P4 1428 aa46.68■■■■■ 5.06
CKB-206ENST00000553994 FANCAO15360 1455 aa46.66■■■■■ 5.06
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CKB-206ENST00000553994 AKNAQ7Z591 1439 aa46.55■■■■■ 5.04
CKB-206ENST00000553994 MTUS2Q5JR59 1369 aa46.53■■■■■ 5.04
CKB-206ENST00000553994 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa46.49■■■■■ 5.03
CKB-206ENST00000553994 PREX2Q70Z35 1606 aa46.48■■■■■ 5.03
CKB-206ENST00000553994 ARHGAP5Q13017 1502 aa46.47■■■■■ 5.03
CKB-206ENST00000553994 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa46.46■■■■■ 5.03
CKB-206ENST00000553994 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP46.44■■■■■ 5.03
CKB-206ENST00000553994 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa46.44■■■■■ 5.02
CKB-206ENST00000553994 TIAM1Q13009 1591 aa46.43■■■■■ 5.02
CKB-206ENST00000553994 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa46.42■■■■■ 5.02
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