RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 JPH4Q96JJ6 628 aa28.59■■■□□ 2.17
KCNQ1-205ENST00000496887 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.57■■■□□ 2.16
KCNQ1-205ENST00000496887 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
KCNQ1-205ENST00000496887 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.53■■■□□ 2.16
KCNQ1-205ENST00000496887 IQGAP2Q13576 1575 aa28.41■■■□□ 2.14
KCNQ1-205ENST00000496887 PRXQ9BXM0 1461 aa28.39■■■□□ 2.13
KCNQ1-205ENST00000496887 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.38■■■□□ 2.13
KCNQ1-205ENST00000496887 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.33■■■□□ 2.13
KCNQ1-205ENST00000496887 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.32■■■□□ 2.12
KCNQ1-205ENST00000496887 EEA1Q15075 1411 aa28.31■■■□□ 2.12
KCNQ1-205ENST00000496887 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
KCNQ1-205ENST00000496887 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.26■■■□□ 2.12
KCNQ1-205ENST00000496887 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.24■■■□□ 2.11
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
KCNQ1-205ENST00000496887 DISP1Q96F81 1524 aa28.22■■■□□ 2.11
KCNQ1-205ENST00000496887 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.19■■■□□ 2.1
KCNQ1-205ENST00000496887 PTPRGP23470 1445 aa28.18■■■□□ 2.1
KCNQ1-205ENST00000496887 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
KCNQ1-205ENST00000496887 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.17■■■□□ 2.1
KCNQ1-205ENST00000496887 KIAA0556O60303 1618 aa28.14■■■□□ 2.1
KCNQ1-205ENST00000496887 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.08■■■□□ 2.09
KCNQ1-205ENST00000496887 KIF21BO75037 1637 aa28.07■■■□□ 2.08
KCNQ1-205ENST00000496887 GOLGA3Q08378 1498 aa28.06■■■□□ 2.08
KCNQ1-205ENST00000496887 UACAQ9BZF9 1416 aa28■■■□□ 2.07
KCNQ1-205ENST00000496887 MAPKBP1O60336 1514 aa27.98■■■□□ 2.07
KCNQ1-205ENST00000496887 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.97■■■□□ 2.07
KCNQ1-205ENST00000496887 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.97■■■□□ 2.07
KCNQ1-205ENST00000496887 ABCC2Q92887 1545 aa27.96■■■□□ 2.07
KCNQ1-205ENST00000496887 SAMD9Q5K651 1589 aa27.92■■■□□ 2.06
KCNQ1-205ENST00000496887 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.92■■■□□ 2.06
KCNQ1-205ENST00000496887 P3H3Q8IVL6 736 aa27.91■■■□□ 2.06
KCNQ1-205ENST00000496887 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
KCNQ1-205ENST00000496887 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.88■■■□□ 2.05
KCNQ1-205ENST00000496887 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.88■■■□□ 2.05
KCNQ1-205ENST00000496887 DIP2BQ9P265 1576 aa27.86■■■□□ 2.05
KCNQ1-205ENST00000496887 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.85■■■□□ 2.05
KCNQ1-205ENST00000496887 ABCA8O94911 1581 aa27.85■■■□□ 2.05
KCNQ1-205ENST00000496887 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
KCNQ1-205ENST00000496887 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.83■■■□□ 2.05
KCNQ1-205ENST00000496887 ASXL2Q76L83 1435 aa27.8■■■□□ 2.04
KCNQ1-205ENST00000496887 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.75■■■□□ 2.03
KCNQ1-205ENST00000496887 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.74■■■□□ 2.03
KCNQ1-205ENST00000496887 TSPOAP1O95153 1857 aa27.69■■■□□ 2.02
KCNQ1-205ENST00000496887 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.69■■■□□ 2.02
KCNQ1-205ENST00000496887 GLI2P10070 1586 aa27.66■■■□□ 2.02
KCNQ1-205ENST00000496887 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
KCNQ1-205ENST00000496887 ARID3CA6NKF2 412 aa27.63■■■□□ 2.01
KCNQ1-205ENST00000496887 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.63■■■□□ 2.01
KCNQ1-205ENST00000496887 ATP10BO94823 1461 aa27.62■■■□□ 2.01
KCNQ1-205ENST00000496887 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.59■■■□□ 2.01
KCNQ1-205ENST00000496887 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
KCNQ1-205ENST00000496887 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.55■■■□□ 2
KCNQ1-205ENST00000496887 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
KCNQ1-205ENST00000496887 KCNH8Q96L42 1107 aa27.52■■■□□ 2
KCNQ1-205ENST00000496887 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
KCNQ1-205ENST00000496887 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
KCNQ1-205ENST00000496887 FMN1Q68DA7 1419 aa27.47■■□□□ 1.99
KCNQ1-205ENST00000496887 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.46■■□□□ 1.99
KCNQ1-205ENST00000496887 KDM6BO15054 1643 aa27.45■■□□□ 1.99
KCNQ1-205ENST00000496887 CD109Q6YHK3 1445 aa27.4■■□□□ 1.98
KCNQ1-205ENST00000496887 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.39■■□□□ 1.98
KCNQ1-205ENST00000496887 HECW1Q76N89 1606 aa27.39■■□□□ 1.98
KCNQ1-205ENST00000496887 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
KCNQ1-205ENST00000496887 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
KCNQ1-205ENST00000496887 CLIP1P30622 1438 aa27.37■■□□□ 1.97
KCNQ1-205ENST00000496887 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.36■■□□□ 1.97
KCNQ1-205ENST00000496887 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.35■■□□□ 1.97
KCNQ1-205ENST00000496887 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.34■■□□□ 1.97
KCNQ1-205ENST00000496887 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.32■■□□□ 1.96
KCNQ1-205ENST00000496887 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
KCNQ1-205ENST00000496887 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
KCNQ1-205ENST00000496887 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.26■■□□□ 1.95
KCNQ1-205ENST00000496887 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.25■■□□□ 1.95
KCNQ1-205ENST00000496887 CEP162Q5TB80 1403 aa27.22■■□□□ 1.95
KCNQ1-205ENST00000496887 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.21■■□□□ 1.95
KCNQ1-205ENST00000496887 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
KCNQ1-205ENST00000496887 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.19■■□□□ 1.94
KCNQ1-205ENST00000496887 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.18■■□□□ 1.94
KCNQ1-205ENST00000496887 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.16■■□□□ 1.94
KCNQ1-205ENST00000496887 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
KCNQ1-205ENST00000496887 NEO1Q92859 1461 aa27.12■■□□□ 1.93
KCNQ1-205ENST00000496887 KIF14Q15058 1648 aa27.12■■□□□ 1.93
KCNQ1-205ENST00000496887 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.11■■□□□ 1.93
KCNQ1-205ENST00000496887 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.1■■□□□ 1.93
KCNQ1-205ENST00000496887 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.06■■□□□ 1.92
KCNQ1-205ENST00000496887 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.06■■□□□ 1.92
KCNQ1-205ENST00000496887 FANCAO15360 1455 aa27.05■■□□□ 1.92
KCNQ1-205ENST00000496887 PLCH2O75038 1416 aa27.02■■□□□ 1.92
KCNQ1-205ENST00000496887 AKNAQ7Z591 1439 aa27.01■■□□□ 1.91
KCNQ1-205ENST00000496887 RAPGEF3O95398 923 aa26.99■■□□□ 1.91
KCNQ1-205ENST00000496887 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.96■■□□□ 1.91
KCNQ1-205ENST00000496887 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
KCNQ1-205ENST00000496887 RICTORQ6R327 1708 aa26.93■■□□□ 1.9
KCNQ1-205ENST00000496887 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.93■■□□□ 1.9
KCNQ1-205ENST00000496887 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
KCNQ1-205ENST00000496887 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.92■■□□□ 1.9
KCNQ1-205ENST00000496887 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.91■■□□□ 1.9
KCNQ1-205ENST00000496887 ADGRL1O94910 1474 aa26.9■■□□□ 1.9
KCNQ1-205ENST00000496887 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms