RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.27■■■■■ 4.2
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KCNQ1-205ENST00000496887 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.66■■■■□ 3.14
KCNQ1-205ENST00000496887 NACADO15069 1562 aa34.57■■■■□ 3.13
KCNQ1-205ENST00000496887 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.56■■■■□ 3.12
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KCNQ1-205ENST00000496887 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.29■■■■□ 3.08
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KCNQ1-205ENST00000496887 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.96■■■■□ 3.03
KCNQ1-205ENST00000496887 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.71■■■□□ 2.99
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KCNQ1-205ENST00000496887 SCRIBQ14160 1630 aa33.56■■■□□ 2.96
KCNQ1-205ENST00000496887 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.26■■■□□ 2.91
KCNQ1-205ENST00000496887 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.18■■■□□ 2.9
KCNQ1-205ENST00000496887 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
KCNQ1-205ENST00000496887 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.66■■■□□ 2.82
KCNQ1-205ENST00000496887 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.43■■■□□ 2.78
KCNQ1-205ENST00000496887 SMARCA4P51532 1647 aa32.07■■■□□ 2.72
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KCNQ1-205ENST00000496887 NCAPD3P42695 1498 aa31.89■■■□□ 2.7
KCNQ1-205ENST00000496887 SMARCA2P51531 1590 aa31.85■■■□□ 2.69
KCNQ1-205ENST00000496887 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.81■■■□□ 2.68
KCNQ1-205ENST00000496887 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.73■■■□□ 2.67
KCNQ1-205ENST00000496887 HMGXB3Q12766 1538 aa31.73■■■□□ 2.67
KCNQ1-205ENST00000496887 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
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KCNQ1-205ENST00000496887 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
KCNQ1-205ENST00000496887 NESP48681 1621 aa31.2■■■□□ 2.59
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KCNQ1-205ENST00000496887 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.88■■■□□ 2.53
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KCNQ1-205ENST00000496887 CUX2O14529 1486 aa30.8■■■□□ 2.52
KCNQ1-205ENST00000496887 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.76■■■□□ 2.52
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KCNQ1-205ENST00000496887 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.62■■■□□ 2.49
KCNQ1-205ENST00000496887 PRDM2Q13029 1718 aa30.59■■■□□ 2.49
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KCNQ1-205ENST00000496887 WDR62O43379 1518 aa30.47■■■□□ 2.47
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KCNQ1-205ENST00000496887 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.58■■■□□ 2.33
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KCNQ1-205ENST00000496887 WDR97A6NE52 1622 aa29.56■■■□□ 2.32
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KCNQ1-205ENST00000496887 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.11■■■□□ 2.25
KCNQ1-205ENST00000496887 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.11■■■□□ 2.25
KCNQ1-205ENST00000496887 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.1■■■□□ 2.25
KCNQ1-205ENST00000496887 ADAMTS12P58397 1594 aa29.09■■■□□ 2.25
KCNQ1-205ENST00000496887 ARHGEF11O15085 1522 aa29.05■■■□□ 2.24
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KCNQ1-205ENST00000496887 TRIM41Q8WV44 630 aa29.02■■■□□ 2.24
KCNQ1-205ENST00000496887 GRIN2AQ12879 1464 aa29.02■■■□□ 2.24
KCNQ1-205ENST00000496887 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.02■■■□□ 2.24
KCNQ1-205ENST00000496887 KIF27Q86VH2 1401 aa28.98■■■□□ 2.23
KCNQ1-205ENST00000496887 CEP170Q5SW79 1584 aa28.9■■■□□ 2.22
KCNQ1-205ENST00000496887 IGF1RP08069 1367 aa28.88■■■□□ 2.21
KCNQ1-205ENST00000496887 NUP160Q12769 1436 aa28.87■■■□□ 2.21
KCNQ1-205ENST00000496887 CUL7Q14999 1698 aa28.83■■■□□ 2.21
KCNQ1-205ENST00000496887 ARAP1Q96P48 1450 aa28.81■■■□□ 2.2
KCNQ1-205ENST00000496887 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.8■■■□□ 2.2
KCNQ1-205ENST00000496887 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.73■■■□□ 2.19
KCNQ1-205ENST00000496887 SHROOM2Q13796 1616 aa28.71■■■□□ 2.19
KCNQ1-205ENST00000496887 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.71■■■□□ 2.19
KCNQ1-205ENST00000496887 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.67■■■□□ 2.18
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