RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407319.6

TRIOBP-205, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIOBP, Length 2,125 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-205ENST00000407319 SYNJ2O15056 1496 aa42.05■■■■■ 4.32
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TRIOBP-205ENST00000407319 FBLN2P98095 1184 aa42■■■■■ 4.31
TRIOBP-205ENST00000407319 GRIN2AQ12879 1464 aa42■■■■■ 4.31
TRIOBP-205ENST00000407319 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
TRIOBP-205ENST00000407319 CHD1O14646 1710 aa41.94■■■■■ 4.3
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TRIOBP-205ENST00000407319 CEP170Q5SW79 1584 aa41.82■■■■■ 4.29
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TRIOBP-205ENST00000407319 NUP160Q12769 1436 aa41.7■■■■■ 4.27
TRIOBP-205ENST00000407319 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.65■■■■■ 4.26
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TRIOBP-205ENST00000407319 ARAP1Q96P48 1450 aa41.56■■■■■ 4.24
TRIOBP-205ENST00000407319 P3H3Q8IVL6 736 aa41.53■■■■■ 4.24
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TRIOBP-205ENST00000407319 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
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TRIOBP-205ENST00000407319 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.45■■■■■ 4.23
TRIOBP-205ENST00000407319 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
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TRIOBP-205ENST00000407319 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.35■■■■■ 4.21
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TRIOBP-205ENST00000407319 DISP1Q96F81 1524 aa41.34■■■■■ 4.21
TRIOBP-205ENST00000407319 KIAA0556O60303 1618 aa41.31■■■■■ 4.2
TRIOBP-205ENST00000407319 SHROOM2Q13796 1616 aa41.26■■■■■ 4.2
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TRIOBP-205ENST00000407319 OSCARQ8IYS5 282 aa41.15■■■■■ 4.18
TRIOBP-205ENST00000407319 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.13■■■■■ 4.17
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TRIOBP-205ENST00000407319 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.1■■■■■ 4.17
TRIOBP-205ENST00000407319 FMN1Q68DA7 1419 aa41.07■■■■■ 4.16
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TRIOBP-205ENST00000407319 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.94■■■■■ 4.14
TRIOBP-205ENST00000407319 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.93■■■■■ 4.14
TRIOBP-205ENST00000407319 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.84■■■■■ 4.13
TRIOBP-205ENST00000407319 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.83■■■■■ 4.13
TRIOBP-205ENST00000407319 PTPRGP23470 1445 aa40.81■■■■■ 4.12
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TRIOBP-205ENST00000407319 HECW1Q76N89 1606 aa40.79■■■■■ 4.12
TRIOBP-205ENST00000407319 TIAM1Q13009 1591 aa40.78■■■■■ 4.12
TRIOBP-205ENST00000407319 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.77■■■■■ 4.12
TRIOBP-205ENST00000407319 ARID3CA6NKF2 412 aa40.75■■■■■ 4.11
TRIOBP-205ENST00000407319 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
TRIOBP-205ENST00000407319 ABCA8O94911 1581 aa40.73■■■■■ 4.11
TRIOBP-205ENST00000407319 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
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TRIOBP-205ENST00000407319 ATP10BO94823 1461 aa40.43■■■■■ 4.06
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TRIOBP-205ENST00000407319 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.36■■■■■ 4.05
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TRIOBP-205ENST00000407319 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.89■■■■□ 3.98
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TRIOBP-205ENST00000407319 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.86■■■■□ 3.97
TRIOBP-205ENST00000407319 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa39.84■■■■□ 3.97
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TRIOBP-205ENST00000407319 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
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TRIOBP-205ENST00000407319 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.82■■■■□ 3.96
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