RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308153.8

H2AFV-202, Transcript of H2A histone family member V, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene H2AFV, Length 752 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFV-202ENST00000308153 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP50.04■■■■■ 5.6
H2AFV-202ENST00000308153 JPH4Q96JJ6 628 aa50.04■■■■■ 5.6
H2AFV-202ENST00000308153 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa49.89■■■■■ 5.58
H2AFV-202ENST00000308153 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.87■■■■■ 5.57
H2AFV-202ENST00000308153 IQGAP2Q13576 1575 aa49.46■■■■■ 5.51
H2AFV-202ENST00000308153 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa49.46■■■■■ 5.51
H2AFV-202ENST00000308153 ADCY10Q96PN6 1610 aa49.45■■■■■ 5.51
H2AFV-202ENST00000308153 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa49.33■■■■■ 5.49
H2AFV-202ENST00000308153 KIF13AQ9H1H9 1805 aa49.32■■■■■ 5.49
H2AFV-202ENST00000308153 PTPRGP23470 1445 aa49.31■■■■■ 5.48
H2AFV-202ENST00000308153 MAPKBP1O60336 1514 aa49.3■■■■■ 5.48
H2AFV-202ENST00000308153 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP49.28■■■■■ 5.48
H2AFV-202ENST00000308153 TNIKQ9UKE5 1360 aa49.27■■■■■ 5.48
H2AFV-202ENST00000308153 DISP1Q96F81 1524 aa49.24■■■■■ 5.47
H2AFV-202ENST00000308153 UGGT2Q9NYU1 1516 aa49.19■■■■■ 5.47
H2AFV-202ENST00000308153 ABCC10Q5T3U5 1492 aa49.19■■■■■ 5.47
H2AFV-202ENST00000308153 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP49.14■■■■■ 5.46
H2AFV-202ENST00000308153 PRXQ9BXM0 1461 aa49.12■■■■■ 5.45
H2AFV-202ENST00000308153 DIP2BQ9P265 1576 aa49.1■■■■■ 5.45
H2AFV-202ENST00000308153 FAM69CQ0P6D2 419 aa49.07■■■■■ 5.45
H2AFV-202ENST00000308153 KIAA0556O60303 1618 aa49.03■■■■■ 5.44
H2AFV-202ENST00000308153 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa49.03■■■■■ 5.44
H2AFV-202ENST00000308153 ABCC2Q92887 1545 aa49.03■■■■■ 5.44
H2AFV-202ENST00000308153 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa49■■■■■ 5.44
H2AFV-202ENST00000308153 UACAQ9BZF9 1416 aa48.96■■■■■ 5.43
H2AFV-202ENST00000308153 ASXL2Q76L83 1435 aa48.8■■■■■ 5.4
H2AFV-202ENST00000308153 KDM5BQ9UGL1 1544 aa48.78■■■■■ 5.4
H2AFV-202ENST00000308153 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48.77■■■■■ 5.4
H2AFV-202ENST00000308153 GOLGA3Q08378 1498 aa48.77■■■■■ 5.4
H2AFV-202ENST00000308153 PLB1Q6P1J6 1458 aa48.75■■■■■ 5.4
H2AFV-202ENST00000308153 EEA1Q15075 1411 aa48.66■■■■■ 5.38
H2AFV-202ENST00000308153 TSPOAP1O95153 1857 aa48.65■■■■■ 5.38
H2AFV-202ENST00000308153 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP48.65■■■■■ 5.38
H2AFV-202ENST00000308153 GLI2P10070 1586 aa48.64■■■■■ 5.38
H2AFV-202ENST00000308153 ABCA8O94911 1581 aa48.56■■■■■ 5.36
H2AFV-202ENST00000308153 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP48.52■■■■■ 5.36
H2AFV-202ENST00000308153 KDM6BO15054 1643 aa48.51■■■■■ 5.36
H2AFV-202ENST00000308153 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP48.48■■■■■ 5.35
H2AFV-202ENST00000308153 SAMD9Q5K651 1589 aa48.41■■■■■ 5.34
H2AFV-202ENST00000308153 WDR7Q9Y4E6 1490 aa48.4■■■■■ 5.34
H2AFV-202ENST00000308153 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP48.39■■■■■ 5.34
H2AFV-202ENST00000308153 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa48.39■■■■■ 5.34
H2AFV-202ENST00000308153 P3H3Q8IVL6 736 aa48.37■■■■■ 5.33
H2AFV-202ENST00000308153 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP48.35■■■■■ 5.33
H2AFV-202ENST00000308153 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.28■■■■■ 5.32
H2AFV-202ENST00000308153 KIF21BO75037 1637 aa48.27■■■■■ 5.32
H2AFV-202ENST00000308153 TEX14Q8IWB6 1497 aa48.16■■■■■ 5.3
H2AFV-202ENST00000308153 ATP10BO94823 1461 aa48.15■■■■■ 5.3
H2AFV-202ENST00000308153 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP48.13■■■■■ 5.3
H2AFV-202ENST00000308153 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa48.1■■■■■ 5.29
H2AFV-202ENST00000308153 ARID3CA6NKF2 412 aa48.09■■■■■ 5.29
H2AFV-202ENST00000308153 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP48.09■■■■■ 5.29
H2AFV-202ENST00000308153 KCNH8Q96L42 1107 aa48.09■■■■■ 5.29
H2AFV-202ENST00000308153 FHOD3Q2V2M9 1422 aa48.07■■■■■ 5.28
H2AFV-202ENST00000308153 CFAP43Q8NDM7 1665 aa48.06■■■■■ 5.28
H2AFV-202ENST00000308153 CD109Q6YHK3 1445 aa48.04■■■■■ 5.28
H2AFV-202ENST00000308153 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa48.02■■■■■ 5.28
H2AFV-202ENST00000308153 EFCAB5A4FU69 1503 aa47.97■■■■■ 5.27
H2AFV-202ENST00000308153 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP47.96■■■■■ 5.27
H2AFV-202ENST00000308153 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa47.87■■■■■ 5.25
H2AFV-202ENST00000308153 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.83■■■■■ 5.25
H2AFV-202ENST00000308153 ABCA9Q8IUA7 1624 aa47.81■■■■■ 5.24
H2AFV-202ENST00000308153 UBTFP17480 764 aaKnown RBP47.8■■■■■ 5.24
H2AFV-202ENST00000308153 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP47.76■■■■■ 5.24
H2AFV-202ENST00000308153 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP47.76■■■■■ 5.24
H2AFV-202ENST00000308153 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa47.65■■■■■ 5.22
H2AFV-202ENST00000308153 ARAP3Q8WWN8 1544 aa47.63■■■■■ 5.22
H2AFV-202ENST00000308153 ADGRL1O94910 1474 aa47.59■■■■■ 5.21
H2AFV-202ENST00000308153 PLEKHD1A6NEE1 506 aa47.56■■■■■ 5.2
H2AFV-202ENST00000308153 PHLDB1Q86UU1 1377 aa47.53■■■■■ 5.2
H2AFV-202ENST00000308153 FMN1Q68DA7 1419 aa47.53■■■■■ 5.2
H2AFV-202ENST00000308153 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP47.51■■■■■ 5.2
H2AFV-202ENST00000308153 NEO1Q92859 1461 aa47.5■■■■■ 5.19
H2AFV-202ENST00000308153 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP47.42■■■■■ 5.182e-6■■□□□ 13.3
H2AFV-202ENST00000308153 HECW1Q76N89 1606 aa47.41■■■■■ 5.18
H2AFV-202ENST00000308153 TTC37Q6PGP7 1564 aa47.37■■■■■ 5.17
H2AFV-202ENST00000308153 RAPGEF3O95398 923 aa47.33■■■■■ 5.17
H2AFV-202ENST00000308153 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa47.31■■■■■ 5.16
H2AFV-202ENST00000308153 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP47.29■■■■■ 5.16
H2AFV-202ENST00000308153 FANCAO15360 1455 aa47.25■■■■■ 5.15
H2AFV-202ENST00000308153 AKNAQ7Z591 1439 aa47.22■■■■■ 5.15
H2AFV-202ENST00000308153 CFAP74Q9C0B2 1584 aa47.2■■■■■ 5.15
H2AFV-202ENST00000308153 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa47.18■■■■■ 5.14
H2AFV-202ENST00000308153 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP47.15■■■■■ 5.14
H2AFV-202ENST00000308153 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP47.13■■■■■ 5.14
H2AFV-202ENST00000308153 RICTORQ6R327 1708 aa47.13■■■■■ 5.13
H2AFV-202ENST00000308153 PLCH2O75038 1416 aa47.12■■■■■ 5.13
H2AFV-202ENST00000308153 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP47.1■■■■■ 5.13
H2AFV-202ENST00000308153 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP47.09■■■■■ 5.13
H2AFV-202ENST00000308153 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa47.08■■■■■ 5.13
H2AFV-202ENST00000308153 KIF14Q15058 1648 aa47.08■■■■■ 5.13
H2AFV-202ENST00000308153 CLIP1P30622 1438 aa47.01■■■■■ 5.12
H2AFV-202ENST00000308153 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa47■■■■■ 5.12
H2AFV-202ENST00000308153 MYO5CQ9NQX4 1742 aa46.99■■■■■ 5.11
H2AFV-202ENST00000308153 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa46.98■■■■■ 5.11
H2AFV-202ENST00000308153 CCDC18Q5T9S5 1454 aa46.97■■■■■ 5.11
H2AFV-202ENST00000308153 ADAMTSL3P82987 1691 aa46.92■■■■■ 5.1
H2AFV-202ENST00000308153 FYCO1Q9BQS8 1478 aa46.92■■■■■ 5.1
H2AFV-202ENST00000308153 SCAPERQ9BY12 1400 aa46.92■■■■■ 5.1
H2AFV-202ENST00000308153 POGZQ7Z3K3 1410 aa46.89■■■■■ 5.1
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