RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ipo9Q91YE6 1041 aa29.24■■■□□ 2.27
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abcc6Q9R1S7 1498 aa29.23■■■□□ 2.27
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa29.22■■■□□ 2.27
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm20521D3Z5F7 333 aa29.13■■■□□ 2.25
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc30Q8BVF4 654 aa28.89■■■□□ 2.22
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abca8aQ8K442 1620 aa28.87■■■□□ 2.21
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa28.7■■■□□ 2.19
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Efcab6Q6P1E8 1516 aa28.7■■■□□ 2.18
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trpm1Q2TV84 1622 aa28.7■■■□□ 2.18
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa28.69■■■□□ 2.18
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Stag3O70576 1240 aa28.69■■■□□ 2.18
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