Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK0

Prex1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex1Q69ZK0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC57.65■■■■■ 6.82
Prex1Q69ZK0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC53.64■■■■■ 6.18
Prex1Q69ZK0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.42■■■■■ 5.98
Prex1Q69ZK0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC50.35■■■■■ 5.65
Prex1Q69ZK0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC50.06■■■■■ 5.6
Prex1Q69ZK0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC49.13■■■■■ 5.46
Prex1Q69ZK0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.73■■■■■ 5.39
Prex1Q69ZK0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.53■■■■■ 5.36
Prex1Q69ZK0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
Prex1Q69ZK0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
Prex1Q69ZK0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC47.99■■■■■ 5.27
Prex1Q69ZK0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
Prex1Q69ZK0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC46.91■■■■■ 5.1
Prex1Q69ZK0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
Prex1Q69ZK0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC46.55■■■■■ 5.04
Prex1Q69ZK0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
Prex1Q69ZK0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.35■■■■■ 5.01
Prex1Q69ZK0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
Prex1Q69ZK0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC45.97■■■■■ 4.95
Prex1Q69ZK0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
Prex1Q69ZK0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
Prex1Q69ZK0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
Prex1Q69ZK0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.68■■■■■ 4.9
Prex1Q69ZK0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC45.61■■■■■ 4.89
Prex1Q69ZK0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.88
Prex1Q69ZK0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
Prex1Q69ZK0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC45.32■■■■■ 4.85
Prex1Q69ZK0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
Prex1Q69ZK0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
Prex1Q69ZK0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
Prex1Q69ZK0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Prex1Q69ZK0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
Prex1Q69ZK0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
Prex1Q69ZK0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC44.63■■■■■ 4.74
Prex1Q69ZK0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Prex1Q69ZK0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC44.23■■■■■ 4.67
Prex1Q69ZK0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
Prex1Q69ZK0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
Prex1Q69ZK0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC44.05■■■■■ 4.64
Prex1Q69ZK0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Prex1Q69ZK0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Prex1Q69ZK0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Prex1Q69ZK0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
Prex1Q69ZK0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC43.65■■■■■ 4.58
Prex1Q69ZK0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
Prex1Q69ZK0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
Prex1Q69ZK0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
Prex1Q69ZK0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Prex1Q69ZK0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC43.23■■■■■ 4.51
Prex1Q69ZK0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
Prex1Q69ZK0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
Prex1Q69ZK0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
Prex1Q69ZK0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
Prex1Q69ZK0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
Prex1Q69ZK0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Prex1Q69ZK0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC42.84■■■■■ 4.45
Prex1Q69ZK0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Prex1Q69ZK0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
Prex1Q69ZK0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Prex1Q69ZK0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Prex1Q69ZK0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC42.77■■■■■ 4.44
Prex1Q69ZK0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
Prex1Q69ZK0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
Prex1Q69ZK0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Prex1Q69ZK0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
Prex1Q69ZK0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC42.45■■■■■ 4.39
Prex1Q69ZK0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.39
Prex1Q69ZK0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
Prex1Q69ZK0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
Prex1Q69ZK0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Prex1Q69ZK0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Prex1Q69ZK0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Prex1Q69ZK0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
Prex1Q69ZK0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Prex1Q69ZK0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Prex1Q69ZK0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
Prex1Q69ZK0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Prex1Q69ZK0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Prex1Q69ZK0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Prex1Q69ZK0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Prex1Q69ZK0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Prex1Q69ZK0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
Prex1Q69ZK0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Prex1Q69ZK0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Prex1Q69ZK0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Prex1Q69ZK0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Prex1Q69ZK0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Prex1Q69ZK0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
Prex1Q69ZK0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Prex1Q69ZK0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Prex1Q69ZK0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41.55■■■■■ 4.24
Prex1Q69ZK0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Prex1Q69ZK0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
Prex1Q69ZK0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Prex1Q69ZK0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Prex1Q69ZK0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Prex1Q69ZK0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Prex1Q69ZK0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Prex1Q69ZK0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Prex1Q69ZK0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms