RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NischQ80TM9 1593 aa42.24■■■■■ 4.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa41.3■■■■■ 4.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abcc9P70170 1546 aa41■■■■■ 4.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abcc8B2RUS7 1588 aa40.03■■■■■ 4
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rhox8Q6VSS7 320 aa39.54■■■■□ 3.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rtl1Q7M732 1744 aa38.94■■■■□ 3.82
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc180J3QNE4 1664 aa38.34■■■■□ 3.73
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ScribQ80U72 1612 aa37.25■■■■□ 3.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dcaf1Q80TR8 1506 aa37.24■■■■□ 3.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa37.05■■■■□ 3.52
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa36.69■■■■□ 3.46
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kdm5dQ62240 1548 aa36.59■■■■□ 3.45
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa36.58■■■■□ 3.45
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Baz1aO88379 1555 aa36.57■■■■□ 3.45
Trafd1-201ENSMUST00000042312 HrcG5E8J6 738 aa36.51■■■■□ 3.44
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NacadQ5SWP3 1504 aa36.18■■■■□ 3.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trim41Q5NCC3 630 aa35.89■■■■□ 3.34
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smarca2Q6DIC0 1577 aa35.78■■■■□ 3.32
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Crybg2B7ZCC2 1516 aa35.71■■■■□ 3.31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sycp2Q9CUU3 1500 aa35.41■■■■□ 3.26
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cep164Q5DU05 1446 aa35.39■■■■□ 3.26
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cngb1E1AZ71 1325 aa35.04■■■■□ 3.2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Chic1Q8CBW7 227 aa34.99■■■■□ 3.19
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa34.97■■■■□ 3.19
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcgf6Q99NA9 353 aa34.84■■■■□ 3.17
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gab3Q8BSM5 595 aa34.81■■■■□ 3.16
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa34.72■■■■□ 3.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Synj1Q8CHC4 1574 aa34.71■■■■□ 3.15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Golga3P55937 1487 aa34.68■■■■□ 3.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 BicraF8VPZ9 1578 aa34.66■■■■□ 3.14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CftrP26361 1476 aa34.4■■■■□ 3.1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Top2bQ64511 1612 aa34.26■■■■□ 3.07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa34.17■■■■□ 3.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mier1Q5UAK0 511 aa34.07■■■■□ 3.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa34.03■■■■□ 3.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zeb1Q64318 1117 aa33.92■■■■□ 3.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NefmP08553 848 aa33.88■■■■□ 3.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa33.73■■■□□ 2.99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fmn1Q05860 1466 aa33.68■■■□□ 2.98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 UbtfP25976 765 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa33.49■■■□□ 2.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cep162Q6ZQ06 1403 aa33.47■■■□□ 2.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Myt1lP97500 1187 aa33.46■■■□□ 2.95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sall2Q9QX96 1004 aa33.44■■■□□ 2.94
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Neurod1Q60867 357 aa33.42■■■□□ 2.94
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Npm2Q80W85 207 aa33.27■■■□□ 2.92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP33.12■■■□□ 2.89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Clip1Q922J3 1391 aa33.05■■■□□ 2.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TnnQ80Z71 1560 aa33.04■■■□□ 2.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP33.03■■■□□ 2.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa33.02■■■□□ 2.88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wdr66E9Q743 1299 aa32.99■■■□□ 2.87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arhgap35Q91YM2 1499 aa32.85■■■□□ 2.85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PtprkP35822 1457 aa32.84■■■□□ 2.85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Frmpd1A2AKB4 1549 aa32.82■■■□□ 2.84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa32.77■■■□□ 2.84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wdr62Q3U3T8 1523 aa32.74■■■□□ 2.83
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa32.73■■■□□ 2.83
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TonslQ6NZL6 1363 aa32.73■■■□□ 2.83
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Il27Q8K3I6 234 aa32.72■■■□□ 2.83
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ClspnQ80YR7 1315 aa32.71■■■□□ 2.83
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NrkQ9R0G8 1455 aa32.7■■■□□ 2.83
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lamc3Q9R0B6 1581 aa32.68■■■□□ 2.82
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arap1Q4LDD4 1452 aa32.64■■■□□ 2.82
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa32.61■■■□□ 2.81
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif15Q6P9L6 1387 aa32.6■■■□□ 2.81
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eea1Q8BL66 1411 aa32.59■■■□□ 2.81
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Anks4bQ8K3X6 423 aa32.59■■■□□ 2.81
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Shroom4Q1W617 1475 aa32.54■■■□□ 2.8
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Unc13aQ4KUS2 1712 aa32.53■■■□□ 2.8
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Camsap1A2AHC3 1581 aa32.5■■■□□ 2.79
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa32.48■■■□□ 2.79
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Setd5Q5XJV7 1441 aa32.48■■■□□ 2.79
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ercc6F8VPZ5 1481 aa32.4■■■□□ 2.78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Map3k1P53349 1493 aa32.38■■■□□ 2.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc18Q640L5 1455 aa32.35■■■□□ 2.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kdm5bQ80Y84 1544 aa32.33■■■□□ 2.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Csrnp3P59055 597 aa32.32■■■□□ 2.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Grin2bQ01097 1482 aa32.31■■■□□ 2.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eid3Q3V124 375 aa32.3■■■□□ 2.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tiam1Q60610 1591 aa32.27■■■□□ 2.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa32.25■■■□□ 2.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Baz1bQ9Z277 1479 aa32.2■■■□□ 2.75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ankrd26Q811D2 1581 aa32.19■■■□□ 2.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Naip1Q9QWK5 1403 aa32.16■■■□□ 2.74
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