Protein–RNA interactions for Protein: Q6TXD4

Dnmbp, Dynamin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DnmbpQ6TXD4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC55.98■■■■■ 6.55
DnmbpQ6TXD4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC52.36■■■■■ 5.97
DnmbpQ6TXD4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.21■■■■■ 5.79
DnmbpQ6TXD4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC49.11■■■■■ 5.45
DnmbpQ6TXD4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC48.05■■■■■ 5.28
DnmbpQ6TXD4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
DnmbpQ6TXD4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
DnmbpQ6TXD4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
DnmbpQ6TXD4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC46.92■■■■■ 5.1
DnmbpQ6TXD4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
DnmbpQ6TXD4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC46.61■■■■■ 5.05
DnmbpQ6TXD4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
DnmbpQ6TXD4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC46.05■■■■■ 4.96
DnmbpQ6TXD4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
DnmbpQ6TXD4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.68■■■■■ 4.9
DnmbpQ6TXD4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
DnmbpQ6TXD4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
DnmbpQ6TXD4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC45.49■■■■■ 4.87
DnmbpQ6TXD4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.87■■■■■ 4.77
DnmbpQ6TXD4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
DnmbpQ6TXD4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
DnmbpQ6TXD4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
DnmbpQ6TXD4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
DnmbpQ6TXD4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC44.43■■■■■ 4.7
DnmbpQ6TXD4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC44.26■■■■■ 4.68
DnmbpQ6TXD4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
DnmbpQ6TXD4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC43.74■■■■■ 4.59
DnmbpQ6TXD4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.74■■■■■ 4.59
DnmbpQ6TXD4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
DnmbpQ6TXD4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
DnmbpQ6TXD4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
DnmbpQ6TXD4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
DnmbpQ6TXD4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
DnmbpQ6TXD4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
DnmbpQ6TXD4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
DnmbpQ6TXD4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
DnmbpQ6TXD4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
DnmbpQ6TXD4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
DnmbpQ6TXD4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC42.96■■■■■ 4.47
DnmbpQ6TXD4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
DnmbpQ6TXD4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
DnmbpQ6TXD4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
DnmbpQ6TXD4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC42.69■■■■■ 4.43
DnmbpQ6TXD4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
DnmbpQ6TXD4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
DnmbpQ6TXD4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
DnmbpQ6TXD4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
DnmbpQ6TXD4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
DnmbpQ6TXD4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
DnmbpQ6TXD4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
DnmbpQ6TXD4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
DnmbpQ6TXD4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
DnmbpQ6TXD4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
DnmbpQ6TXD4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
DnmbpQ6TXD4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
DnmbpQ6TXD4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
DnmbpQ6TXD4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
DnmbpQ6TXD4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
DnmbpQ6TXD4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
DnmbpQ6TXD4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
DnmbpQ6TXD4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
DnmbpQ6TXD4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
DnmbpQ6TXD4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
DnmbpQ6TXD4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
DnmbpQ6TXD4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
DnmbpQ6TXD4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
DnmbpQ6TXD4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
DnmbpQ6TXD4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
DnmbpQ6TXD4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
DnmbpQ6TXD4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
DnmbpQ6TXD4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
DnmbpQ6TXD4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
DnmbpQ6TXD4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
DnmbpQ6TXD4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40.84■■■■■ 4.13
DnmbpQ6TXD4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
DnmbpQ6TXD4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
DnmbpQ6TXD4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
DnmbpQ6TXD4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
DnmbpQ6TXD4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
DnmbpQ6TXD4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
DnmbpQ6TXD4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
DnmbpQ6TXD4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
DnmbpQ6TXD4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
DnmbpQ6TXD4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
DnmbpQ6TXD4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
DnmbpQ6TXD4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
DnmbpQ6TXD4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
DnmbpQ6TXD4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
DnmbpQ6TXD4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
DnmbpQ6TXD4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
DnmbpQ6TXD4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
DnmbpQ6TXD4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
DnmbpQ6TXD4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
DnmbpQ6TXD4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
DnmbpQ6TXD4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
DnmbpQ6TXD4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
DnmbpQ6TXD4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
DnmbpQ6TXD4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
DnmbpQ6TXD4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
DnmbpQ6TXD4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms