RNA–Protein interactions for RNA: YGR093W

DRN1, Transcript of Splicing factor that modulates turnover of branched RNAs by Dbr1p, yeast

Gene DRN1, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DRN1	YGR093W	SRB7	P47822	140 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	MSS11	Q03825	758 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	FIN1	Q03898	291 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	GMC1	Q04399	608 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	SWT1	Q12104	458 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	CCW14	O13547	238 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	RPL39	P04650	51 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	PDE2	P06776	526 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	HNM1	P19807	563 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	MCH2	P36032	473 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	YHR035W	P38769	630 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	CTK2	P46962	323 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	ILM1	P47155	203 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	YNL046W	P53956	172 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	SAM50	P53969	484 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	GPI17	Q04080	534 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	FMP42	Q04991	504 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	SSK1	Q07084	712 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	CSI2	Q08054	341 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	FRE8	Q12209	686 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DRN1	YGR093W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	RIP-Chip
DRN1	YGR093W	CHO1	P08456	276 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	NAM2	P11325	894 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	FAR1	P21268	830 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	MDM31	P38880	579 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	YHC3	P47040	408 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	GRX5	Q02784	150 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	ARP10	Q04549	284 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	RPB9	P27999	122 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	NDC1	P32500	655 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	FRM2	P37261	193 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	CTR2	P38865	189 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	YDC1	Q02896	317 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	GAL83	Q04739	417 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
DRN1	YGR093W	BPH1	P25356	2167 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	ECT1	P33412	323 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	SHE1	P38200	338 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	ABM1	P47146	123 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	YNR048W	P53740	393 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	AAH1	P53909	347 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	RNH1	Q04740	348 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	YER188W	P40103	239 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	FMC1	P40491	155 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	BNA1	P47096	177 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	CCC1	P47818	322 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	YNR064C	P53750	290 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	NRK1	P53915	240 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	YDR114C	Q04597	100 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	ISA2	Q12425	185 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	VCX1	Q99385	411 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	REC114	P32841	428 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	VMA11	P32842	164 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	THI2	P38141	450 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	YBR285W	P38354	144 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	DLS1	P40366	167 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
DRN1	YGR093W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
DRN1	YGR093W	DUG3	P53871	357 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	RNH201	P53942	307 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	HHT1	P61830	136 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	TLG1	Q03322	224 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	IRC25	Q07951	179 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	RFU1	Q08003	200 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	AFG1	P32317	509 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DRN1	YGR093W	ECM4	P36156	370 aa		4.11	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 90.2 ms