Protein–RNA interactions for Protein: Q12209

FRE8, Probable ferric reductase transmembrane component 8, yeastyeast

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FRE8Q12209 NSR1YGR159C 1245 nt17.21■□□□□ 0.35
FRE8Q12209 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.16■□□□□ 0.34
FRE8Q12209 NOP1YDL014W 984 nt16.78■□□□□ 0.28
FRE8Q12209 YKL036CYKL036C 393 nt15.6■□□□□ 0.09
FRE8Q12209 MDJ1YFL016C 1536 nt15.48■□□□□ 0.07
FRE8Q12209 Q0297Q0297 156 nt14.74□□□□□ -0.05
FRE8Q12209 SRX1YKL086W 384 nt14.66□□□□□ -0.06
FRE8Q12209 YJL027CYJL027C 417 nt14.56□□□□□ -0.08
FRE8Q12209 SCS3YGL126W 1143 nt14.25□□□□□ -0.13
FRE8Q12209 YCR051WYCR051W 669 nt13.88□□□□□ -0.19
FRE8Q12209 DBP2YNL112W 1641 nt13.61□□□□□ -0.23
FRE8Q12209 YOL085CYOL085C 342 nt13.5□□□□□ -0.25
FRE8Q12209 YBR190WYBR190W 312 nt13.27□□□□□ -0.29
FRE8Q12209 PKP1YIL042C 1185 nt13.24□□□□□ -0.29
FRE8Q12209 RPP1BYDL130W 321 nt13.21□□□□□ -0.29
FRE8Q12209 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.18□□□□□ -0.3
FRE8Q12209 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.18□□□□□ -0.3
FRE8Q12209 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.18□□□□□ -0.3
FRE8Q12209 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.18□□□□□ -0.3
FRE8Q12209 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.18□□□□□ -0.3
FRE8Q12209 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.18□□□□□ -0.3
FRE8Q12209 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.18□□□□□ -0.3
FRE8Q12209 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.18□□□□□ -0.3
FRE8Q12209 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.18□□□□□ -0.3
FRE8Q12209 CCC1YLR220W 969 nt13.07□□□□□ -0.32
FRE8Q12209 RTC3YHR087W 336 nt12.96□□□□□ -0.33
FRE8Q12209 SCJ1YMR214W 1134 nt12.84□□□□□ -0.35
FRE8Q12209 ATS1YAL020C 1002 nt12.79□□□□□ -0.36
FRE8Q12209 RVS167YDR388W 1449 nt12.71□□□□□ -0.37
FRE8Q12209 PET122YER153C 765 nt12.59□□□□□ -0.39
FRE8Q12209 SSA3YBL075C 1950 nt12.53□□□□□ -0.4
FRE8Q12209 SCR1SCR1 522 nt12.51□□□□□ -0.41
FRE8Q12209 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.5□□□□□ -0.41
FRE8Q12209 RRN5YLR141W 1092 nt12.24□□□□□ -0.45
FRE8Q12209 SHR5YOL110W 714 nt12.23□□□□□ -0.45
FRE8Q12209 PUT4YOR348C 1884 nt12.22□□□□□ -0.45
FRE8Q12209 YDJ1YNL064C 1230 nt12.12□□□□□ -0.47
FRE8Q12209 URN1YPR152C 1398 nt12.05□□□□□ -0.48
FRE8Q12209 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.01□□□□□ -0.49
FRE8Q12209 RSB1YOR049C 1065 nt12.01□□□□□ -0.49
FRE8Q12209 DEP1YAL013W 1218 nt11.98□□□□□ -0.49
FRE8Q12209 ARE1YCR048W 1833 nt11.93□□□□□ -0.5
FRE8Q12209 OPI9YLR338W 858 nt11.92□□□□□ -0.5
FRE8Q12209 SAH1YER043C 1350 nt11.91□□□□□ -0.5
FRE8Q12209 POA1YBR022W 534 nt11.85□□□□□ -0.51
FRE8Q12209 PST2YDR032C 597 nt11.84□□□□□ -0.51
FRE8Q12209 RPN10YHR200W 807 nt11.8□□□□□ -0.52
FRE8Q12209 GAR1YHR089C 618 nt11.78□□□□□ -0.52
FRE8Q12209 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.76□□□□□ -0.53
FRE8Q12209 YNL208WYNL208W 600 nt11.76□□□□□ -0.53
FRE8Q12209 BSC6YOL137W 1494 nt11.61□□□□□ -0.55
FRE8Q12209 PUN1YLR414C 792 nt11.56□□□□□ -0.56
FRE8Q12209 BUD23YCR047C 828 nt11.49□□□□□ -0.57
FRE8Q12209 YJR018WYJR018W 363 nt11.49□□□□□ -0.57
FRE8Q12209 PTC2YER089C 1395 nt11.47□□□□□ -0.57
FRE8Q12209 YKL097CYKL097C 411 nt11.42□□□□□ -0.58
FRE8Q12209 TIR1YER011W 765 nt11.4□□□□□ -0.58
FRE8Q12209 NAB2YGL122C 1578 nt11.35□□□□□ -0.59
FRE8Q12209 SHU1YHL006C 453 nt11.3□□□□□ -0.6
FRE8Q12209 SSA1YAL005C 1929 nt11.3□□□□□ -0.6
FRE8Q12209 YJR120WYJR120W 351 nt11.25□□□□□ -0.61
FRE8Q12209 SPT5YML010W 3192 nt11.23□□□□□ -0.61
FRE8Q12209 RPP2BYDR382W 333 nt11.17□□□□□ -0.62
FRE8Q12209 DAL1YIR027C 1383 nt11.15□□□□□ -0.63
FRE8Q12209 FIS1YIL065C 468 nt11.14□□□□□ -0.63
FRE8Q12209 FPR4YLR449W 1179 nt11.13□□□□□ -0.63
FRE8Q12209 INM2YDR287W 879 nt11.11□□□□□ -0.63
FRE8Q12209 SRB2YHR041C 633 nt11.07□□□□□ -0.64
FRE8Q12209 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.05□□□□□ -0.64
FRE8Q12209 SSA4YER103W 1929 nt11.04□□□□□ -0.64
FRE8Q12209 PHO4YFR034C 939 nt11.04□□□□□ -0.64
FRE8Q12209 YBL100CYBL100C 315 nt10.95□□□□□ -0.66
FRE8Q12209 YOR139CYOR139C 393 nt10.94□□□□□ -0.66
FRE8Q12209 MEP2YNL142W 1500 nt10.93□□□□□ -0.66
FRE8Q12209 YGR021WYGR021W 873 nt10.92□□□□□ -0.66
FRE8Q12209 BDH2YAL061W 1254 nt10.92□□□□□ -0.66
FRE8Q12209 YPS1YLR120C 1710 nt10.92□□□□□ -0.66
FRE8Q12209 WWM1YFL010C 636 nt10.9□□□□□ -0.66
FRE8Q12209 HOM6YJR139C 1080 nt10.88□□□□□ -0.67
FRE8Q12209 NPL3YDR432W 1245 nt10.82□□□□□ -0.68
FRE8Q12209 FUN26YAL022C 1554 nt10.82□□□□□ -0.68
FRE8Q12209 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.81□□□□□ -0.68
FRE8Q12209 YDR095CYDR095C 411 nt10.8□□□□□ -0.68
FRE8Q12209 MNP1YGL068W 585 nt10.8□□□□□ -0.68
FRE8Q12209 TRM9YML014W 840 nt10.77□□□□□ -0.69
FRE8Q12209 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.76□□□□□ -0.69
FRE8Q12209 DCW1YKL046C 1350 nt10.76□□□□□ -0.69
FRE8Q12209 LSM3YLR438C-A 270 nt10.74□□□□□ -0.69
FRE8Q12209 YOL037CYOL037C 354 nt10.73□□□□□ -0.69
FRE8Q12209 RKM5YLR137W 1104 nt10.72□□□□□ -0.69
FRE8Q12209 PAC11YDR488C 1602 nt10.7□□□□□ -0.7
FRE8Q12209 ALF1YNL148C 765 nt10.7□□□□□ -0.7
FRE8Q12209 CCT6YDR188W 1641 nt10.64□□□□□ -0.71
FRE8Q12209 RPP2AYOL039W 321 nt10.63□□□□□ -0.71
FRE8Q12209 BDF1YLR399C 2061 nt10.62□□□□□ -0.71
FRE8Q12209 EMI2YDR516C 1503 nt10.62□□□□□ -0.71
FRE8Q12209 PTP1YDL230W 1008 nt10.61□□□□□ -0.71
FRE8Q12209 NVJ2YPR091C 2313 nt10.59□□□□□ -0.71
FRE8Q12209 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.57□□□□□ -0.72
FRE8Q12209 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 85.3 ms