Protein–RNA interactions for Protein: Q08054

CSI2, Chitin synthase 3 complex protein CSI2, yeastyeast

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI2Q08054 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.06■□□□□ 0.32
CSI2Q08054 NSR1YGR159C 1245 nt16.87■□□□□ 0.29
CSI2Q08054 NOP1YDL014W 984 nt16.71■□□□□ 0.27
CSI2Q08054 YKL036CYKL036C 393 nt15.56■□□□□ 0.08
CSI2Q08054 MDJ1YFL016C 1536 nt14.74□□□□□ -0.05
CSI2Q08054 Q0297Q0297 156 nt14.7□□□□□ -0.06
CSI2Q08054 SRX1YKL086W 384 nt14.6□□□□□ -0.07
CSI2Q08054 YJL027CYJL027C 417 nt14.52□□□□□ -0.09
CSI2Q08054 SCS3YGL126W 1143 nt14.21□□□□□ -0.13
CSI2Q08054 YCR051WYCR051W 669 nt13.8□□□□□ -0.2
CSI2Q08054 YOL085CYOL085C 342 nt13.45□□□□□ -0.26
CSI2Q08054 RPP1BYDL130W 321 nt13.17□□□□□ -0.3
CSI2Q08054 PKP1YIL042C 1185 nt13.16□□□□□ -0.3
CSI2Q08054 DBP2YNL112W 1641 nt13.14□□□□□ -0.31
CSI2Q08054 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.1□□□□□ -0.31
CSI2Q08054 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.1□□□□□ -0.31
CSI2Q08054 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.1□□□□□ -0.31
CSI2Q08054 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.1□□□□□ -0.31
CSI2Q08054 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.1□□□□□ -0.31
CSI2Q08054 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.1□□□□□ -0.31
CSI2Q08054 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.1□□□□□ -0.31
CSI2Q08054 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.1□□□□□ -0.31
CSI2Q08054 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.1□□□□□ -0.31
CSI2Q08054 SSA3YBL075C 1950 nt12.98□□□□□ -0.33
CSI2Q08054 SCJ1YMR214W 1134 nt12.89□□□□□ -0.35
CSI2Q08054 CCC1YLR220W 969 nt12.87□□□□□ -0.35
CSI2Q08054 ATS1YAL020C 1002 nt12.76□□□□□ -0.37
CSI2Q08054 YBR190WYBR190W 312 nt12.61□□□□□ -0.39
CSI2Q08054 PET122YER153C 765 nt12.52□□□□□ -0.41
CSI2Q08054 SCR1SCR1 522 nt12.47□□□□□ -0.41
CSI2Q08054 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.43□□□□□ -0.42
CSI2Q08054 RVS167YDR388W 1449 nt12.43□□□□□ -0.42
CSI2Q08054 RTC3YHR087W 336 nt12.26□□□□□ -0.45
CSI2Q08054 RRN5YLR141W 1092 nt12.18□□□□□ -0.46
CSI2Q08054 YDJ1YNL064C 1230 nt12.07□□□□□ -0.48
CSI2Q08054 SHR5YOL110W 714 nt12.04□□□□□ -0.48
CSI2Q08054 RSB1YOR049C 1065 nt11.96□□□□□ -0.49
CSI2Q08054 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.95□□□□□ -0.5
CSI2Q08054 PST2YDR032C 597 nt11.81□□□□□ -0.52
CSI2Q08054 GAR1YHR089C 618 nt11.68□□□□□ -0.54
CSI2Q08054 URN1YPR152C 1398 nt11.56□□□□□ -0.56
CSI2Q08054 DEP1YAL013W 1218 nt11.55□□□□□ -0.56
CSI2Q08054 RPN10YHR200W 807 nt11.49□□□□□ -0.57
CSI2Q08054 YNL208WYNL208W 600 nt11.47□□□□□ -0.57
CSI2Q08054 YKL097CYKL097C 411 nt11.42□□□□□ -0.58
CSI2Q08054 PUT4YOR348C 1884 nt11.42□□□□□ -0.58
CSI2Q08054 OPI9YLR338W 858 nt11.4□□□□□ -0.58
CSI2Q08054 TIR1YER011W 765 nt11.32□□□□□ -0.6
CSI2Q08054 SHU1YHL006C 453 nt11.26□□□□□ -0.61
CSI2Q08054 SPT5YML010W 3192 nt11.26□□□□□ -0.61
CSI2Q08054 SAH1YER043C 1350 nt11.22□□□□□ -0.61
CSI2Q08054 SSA4YER103W 1929 nt11.2□□□□□ -0.62
CSI2Q08054 ARE1YCR048W 1833 nt11.12□□□□□ -0.63
CSI2Q08054 SSA1YAL005C 1929 nt11.12□□□□□ -0.63
CSI2Q08054 PUN1YLR414C 792 nt11.08□□□□□ -0.64
CSI2Q08054 YJR018WYJR018W 363 nt11.05□□□□□ -0.64
CSI2Q08054 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.98□□□□□ -0.65
CSI2Q08054 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt10.97□□□□□ -0.65
CSI2Q08054 POA1YBR022W 534 nt10.95□□□□□ -0.66
CSI2Q08054 BDF1YLR399C 2061 nt10.94□□□□□ -0.66
CSI2Q08054 SRB2YHR041C 633 nt10.93□□□□□ -0.66
CSI2Q08054 YJR120WYJR120W 351 nt10.92□□□□□ -0.66
CSI2Q08054 YOR139CYOR139C 393 nt10.92□□□□□ -0.66
CSI2Q08054 RPP2BYDR382W 333 nt10.9□□□□□ -0.66
CSI2Q08054 YGR021WYGR021W 873 nt10.89□□□□□ -0.67
CSI2Q08054 BSC6YOL137W 1494 nt10.87□□□□□ -0.67
CSI2Q08054 PAC11YDR488C 1602 nt10.86□□□□□ -0.67
CSI2Q08054 PTC2YER089C 1395 nt10.86□□□□□ -0.67
CSI2Q08054 WWM1YFL010C 636 nt10.82□□□□□ -0.68
CSI2Q08054 HOM6YJR139C 1080 nt10.82□□□□□ -0.68
CSI2Q08054 NPL3YDR432W 1245 nt10.8□□□□□ -0.68
CSI2Q08054 TAT1YBR069C 1860 nt10.77□□□□□ -0.69
CSI2Q08054 NVJ2YPR091C 2313 nt10.76□□□□□ -0.69
CSI2Q08054 MNP1YGL068W 585 nt10.74□□□□□ -0.69
CSI2Q08054 NAB2YGL122C 1578 nt10.73□□□□□ -0.69
CSI2Q08054 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.72□□□□□ -0.69
CSI2Q08054 YOL037CYOL037C 354 nt10.72□□□□□ -0.69
CSI2Q08054 BDH2YAL061W 1254 nt10.71□□□□□ -0.69
CSI2Q08054 BUD23YCR047C 828 nt10.7□□□□□ -0.7
CSI2Q08054 INM2YDR287W 879 nt10.67□□□□□ -0.7
CSI2Q08054 RKM5YLR137W 1104 nt10.66□□□□□ -0.7
CSI2Q08054 LSM3YLR438C-A 270 nt10.64□□□□□ -0.71
CSI2Q08054 DAL1YIR027C 1383 nt10.63□□□□□ -0.71
CSI2Q08054 FIS1YIL065C 468 nt10.6□□□□□ -0.71
CSI2Q08054 YBL100CYBL100C 315 nt10.57□□□□□ -0.72
CSI2Q08054 FPR4YLR449W 1179 nt10.53□□□□□ -0.72
CSI2Q08054 PHO4YFR034C 939 nt10.52□□□□□ -0.73
CSI2Q08054 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.49□□□□□ -0.73
CSI2Q08054 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.49□□□□□ -0.73
CSI2Q08054 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.49□□□□□ -0.73
CSI2Q08054 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.49□□□□□ -0.73
CSI2Q08054 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.49□□□□□ -0.73
CSI2Q08054 TRM9YML014W 840 nt10.46□□□□□ -0.73
CSI2Q08054 FUN26YAL022C 1554 nt10.44□□□□□ -0.74
CSI2Q08054 YLR281CYLR281C 468 nt10.43□□□□□ -0.74
CSI2Q08054 CCT6YDR188W 1641 nt10.37□□□□□ -0.75
CSI2Q08054 WHI5YOR083W 888 nt10.35□□□□□ -0.75
CSI2Q08054 PUS2YGL063W 1113 nt10.34□□□□□ -0.75
CSI2Q08054 MEP2YNL142W 1500 nt10.33□□□□□ -0.76
CSI2Q08054 FPS1YLL043W 2010 nt10.33□□□□□ -0.76
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