Protein–RNA interactions for Protein: Q12104

SWT1, Transcriptional protein SWT1, yeastyeast

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SWT1Q12104 NSR1YGR159C 1245 nt17.05■□□□□ 0.32
SWT1Q12104 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.89■□□□□ 0.29
SWT1Q12104 NOP1YDL014W 984 nt16.35■□□□□ 0.21
SWT1Q12104 MDJ1YFL016C 1536 nt15.32■□□□□ 0.04
SWT1Q12104 YKL036CYKL036C 393 nt14.87□□□□□ -0.03
SWT1Q12104 SRX1YKL086W 384 nt14.31□□□□□ -0.12
SWT1Q12104 Q0297Q0297 156 nt14.27□□□□□ -0.13
SWT1Q12104 YJL027CYJL027C 417 nt14.12□□□□□ -0.15
SWT1Q12104 DBP2YNL112W 1641 nt13.5□□□□□ -0.25
SWT1Q12104 YCR051WYCR051W 669 nt13.49□□□□□ -0.25
SWT1Q12104 SCS3YGL126W 1143 nt13.41□□□□□ -0.26
SWT1Q12104 YBR190WYBR190W 312 nt13.16□□□□□ -0.3
SWT1Q12104 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.09□□□□□ -0.31
SWT1Q12104 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.09□□□□□ -0.31
SWT1Q12104 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.09□□□□□ -0.31
SWT1Q12104 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.09□□□□□ -0.31
SWT1Q12104 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.09□□□□□ -0.31
SWT1Q12104 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.09□□□□□ -0.31
SWT1Q12104 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.09□□□□□ -0.31
SWT1Q12104 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.09□□□□□ -0.31
SWT1Q12104 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.09□□□□□ -0.31
SWT1Q12104 YOL085CYOL085C 342 nt12.89□□□□□ -0.35
SWT1Q12104 CCC1YLR220W 969 nt12.86□□□□□ -0.35
SWT1Q12104 RPP1BYDL130W 321 nt12.79□□□□□ -0.36
SWT1Q12104 RTC3YHR087W 336 nt12.78□□□□□ -0.36
SWT1Q12104 PKP1YIL042C 1185 nt12.67□□□□□ -0.38
SWT1Q12104 RVS167YDR388W 1449 nt12.6□□□□□ -0.39
SWT1Q12104 SCJ1YMR214W 1134 nt12.52□□□□□ -0.41
SWT1Q12104 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.28□□□□□ -0.44
SWT1Q12104 SSA3YBL075C 1950 nt12.28□□□□□ -0.44
SWT1Q12104 Q0182Q0182 405 nt12.26□□□□□ -0.45
SWT1Q12104 PET122YER153C 765 nt12.23□□□□□ -0.45
SWT1Q12104 PUT4YOR348C 1884 nt12.14□□□□□ -0.47
SWT1Q12104 SHR5YOL110W 714 nt12.13□□□□□ -0.47
SWT1Q12104 SCR1SCR1 522 nt12.02□□□□□ -0.49
SWT1Q12104 ATS1YAL020C 1002 nt11.92□□□□□ -0.5
SWT1Q12104 URN1YPR152C 1398 nt11.92□□□□□ -0.5
SWT1Q12104 YDJ1YNL064C 1230 nt11.91□□□□□ -0.5
SWT1Q12104 RRN5YLR141W 1092 nt11.84□□□□□ -0.51
SWT1Q12104 ARE1YCR048W 1833 nt11.83□□□□□ -0.51
SWT1Q12104 OPI9YLR338W 858 nt11.83□□□□□ -0.52
SWT1Q12104 DEP1YAL013W 1218 nt11.8□□□□□ -0.52
SWT1Q12104 SAH1YER043C 1350 nt11.78□□□□□ -0.52
SWT1Q12104 MOT3YMR070W 1473 nt11.74□□□□□ -0.53
SWT1Q12104 RPN10YHR200W 807 nt11.7□□□□□ -0.54
SWT1Q12104 POA1YBR022W 534 nt11.69□□□□□ -0.54
SWT1Q12104 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.66□□□□□ -0.54
SWT1Q12104 YNL208WYNL208W 600 nt11.64□□□□□ -0.55
SWT1Q12104 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.62□□□□□ -0.55
SWT1Q12104 GAR1YHR089C 618 nt11.61□□□□□ -0.55
SWT1Q12104 BSC6YOL137W 1494 nt11.51□□□□□ -0.57
SWT1Q12104 RSB1YOR049C 1065 nt11.5□□□□□ -0.57
SWT1Q12104 PUN1YLR414C 792 nt11.47□□□□□ -0.57
SWT1Q12104 YJR018WYJR018W 363 nt11.36□□□□□ -0.59
SWT1Q12104 PTC2YER089C 1395 nt11.34□□□□□ -0.59
SWT1Q12104 BUD23YCR047C 828 nt11.33□□□□□ -0.6
SWT1Q12104 TIR1YER011W 765 nt11.27□□□□□ -0.61
SWT1Q12104 NAB2YGL122C 1578 nt11.25□□□□□ -0.61
SWT1Q12104 SPT5YML010W 3192 nt11.22□□□□□ -0.61
SWT1Q12104 SSA1YAL005C 1929 nt11.19□□□□□ -0.62
SWT1Q12104 YJR120WYJR120W 351 nt11.18□□□□□ -0.62
SWT1Q12104 PST2YDR032C 597 nt11.11□□□□□ -0.63
SWT1Q12104 FIS1YIL065C 468 nt11.1□□□□□ -0.63
SWT1Q12104 DAL1YIR027C 1383 nt11.06□□□□□ -0.64
SWT1Q12104 RPP2BYDR382W 333 nt11.05□□□□□ -0.64
SWT1Q12104 INM2YDR287W 879 nt11□□□□□ -0.65
SWT1Q12104 SRB2YHR041C 633 nt10.96□□□□□ -0.65
SWT1Q12104 PHO4YFR034C 939 nt10.95□□□□□ -0.66
SWT1Q12104 FPR4YLR449W 1179 nt10.95□□□□□ -0.66
SWT1Q12104 SSA4YER103W 1929 nt10.87□□□□□ -0.67
SWT1Q12104 MEP2YNL142W 1500 nt10.84□□□□□ -0.67
SWT1Q12104 YPS1YLR120C 1710 nt10.84□□□□□ -0.67
SWT1Q12104 YBL100CYBL100C 315 nt10.84□□□□□ -0.67
SWT1Q12104 BDH2YAL061W 1254 nt10.82□□□□□ -0.68
SWT1Q12104 YDR095CYDR095C 411 nt10.75□□□□□ -0.69
SWT1Q12104 WWM1YFL010C 636 nt10.72□□□□□ -0.69
SWT1Q12104 FUN26YAL022C 1554 nt10.71□□□□□ -0.69
SWT1Q12104 SHU1YHL006C 453 nt10.69□□□□□ -0.7
SWT1Q12104 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.69□□□□□ -0.7
SWT1Q12104 LSM3YLR438C-A 270 nt10.66□□□□□ -0.7
SWT1Q12104 DCW1YKL046C 1350 nt10.65□□□□□ -0.71
SWT1Q12104 TRM9YML014W 840 nt10.63□□□□□ -0.71
SWT1Q12104 YGR021WYGR021W 873 nt10.62□□□□□ -0.71
SWT1Q12104 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.59□□□□□ -0.71
SWT1Q12104 CCT6YDR188W 1641 nt10.58□□□□□ -0.72
SWT1Q12104 FPS1YLL043W 2010 nt10.57□□□□□ -0.72
SWT1Q12104 HOM6YJR139C 1080 nt10.57□□□□□ -0.72
SWT1Q12104 ALF1YNL148C 765 nt10.57□□□□□ -0.72
SWT1Q12104 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.55□□□□□ -0.72
SWT1Q12104 PTP1YDL230W 1008 nt10.53□□□□□ -0.72
SWT1Q12104 RPP2AYOL039W 321 nt10.53□□□□□ -0.72
SWT1Q12104 EMI2YDR516C 1503 nt10.52□□□□□ -0.73
SWT1Q12104 YKL097CYKL097C 411 nt10.51□□□□□ -0.73
SWT1Q12104 BDF1YLR399C 2061 nt10.49□□□□□ -0.73
SWT1Q12104 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.48□□□□□ -0.73
SWT1Q12104 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.48□□□□□ -0.73
SWT1Q12104 SIS1YNL007C 1059 nt10.48□□□□□ -0.73
SWT1Q12104 CAC2YML102W 1407 nt10.46□□□□□ -0.74
SWT1Q12104 MNP1YGL068W 585 nt10.45□□□□□ -0.74
SWT1Q12104 YMR090WYMR090W 684 nt10.45□□□□□ -0.74
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