Protein–RNA interactions for Protein: Q04739

GAL83, SNF1 protein kinase subunit beta-3, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GAL83Q04739 NSR1YGR159C 1245 nt18.24■□□□□ 0.51
GAL83Q04739 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.81■□□□□ 0.44
GAL83Q04739 NOP1YDL014W 984 nt17.22■□□□□ 0.35
GAL83Q04739 MDJ1YFL016C 1536 nt16.86■□□□□ 0.29
GAL83Q04739 YKL036CYKL036C 393 nt15.65■□□□□ 0.1
GAL83Q04739 YJL027CYJL027C 417 nt15.51■□□□□ 0.07
GAL83Q04739 SRX1YKL086W 384 nt15.02■□□□□ -0
GAL83Q04739 Q0297Q0297 156 nt14.97□□□□□ -0.01
GAL83Q04739 DBP2YNL112W 1641 nt14.59□□□□□ -0.07
GAL83Q04739 YBR190WYBR190W 312 nt14.53□□□□□ -0.08
GAL83Q04739 SSA3YBL075C 1950 nt14.43□□□□□ -0.1
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GAL83Q04739 YCR051WYCR051W 669 nt14.23□□□□□ -0.13
GAL83Q04739 SCS3YGL126W 1143 nt14.1□□□□□ -0.15
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GAL83Q04739 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.81□□□□□ -0.2
GAL83Q04739 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.81□□□□□ -0.2
GAL83Q04739 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.81□□□□□ -0.2
GAL83Q04739 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.81□□□□□ -0.2
GAL83Q04739 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.81□□□□□ -0.2
GAL83Q04739 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.81□□□□□ -0.2
GAL83Q04739 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.81□□□□□ -0.2
GAL83Q04739 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.81□□□□□ -0.2
GAL83Q04739 CCC1YLR220W 969 nt13.75□□□□□ -0.21
GAL83Q04739 PUT4YOR348C 1884 nt13.69□□□□□ -0.22
GAL83Q04739 RVS167YDR388W 1449 nt13.64□□□□□ -0.23
GAL83Q04739 YOL085CYOL085C 342 nt13.53□□□□□ -0.24
GAL83Q04739 RPP1BYDL130W 321 nt13.43□□□□□ -0.26
GAL83Q04739 SCJ1YMR214W 1134 nt13.38□□□□□ -0.27
GAL83Q04739 PKP1YIL042C 1185 nt13.33□□□□□ -0.28
GAL83Q04739 POA1YBR022W 534 nt13.26□□□□□ -0.29
GAL83Q04739 ARE1YCR048W 1833 nt13.24□□□□□ -0.29
GAL83Q04739 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.11□□□□□ -0.31
GAL83Q04739 BSC6YOL137W 1494 nt13.09□□□□□ -0.31
GAL83Q04739 SAH1YER043C 1350 nt13.08□□□□□ -0.31
GAL83Q04739 URN1YPR152C 1398 nt13.05□□□□□ -0.32
GAL83Q04739 SHR5YOL110W 714 nt12.97□□□□□ -0.33
GAL83Q04739 OPI9YLR338W 858 nt12.96□□□□□ -0.33
GAL83Q04739 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.88□□□□□ -0.35
GAL83Q04739 DEP1YAL013W 1218 nt12.88□□□□□ -0.35
GAL83Q04739 SPT5YML010W 3192 nt12.87□□□□□ -0.35
GAL83Q04739 PET122YER153C 765 nt12.84□□□□□ -0.35
GAL83Q04739 SSA4YER103W 1929 nt12.82□□□□□ -0.36
GAL83Q04739 BUD23YCR047C 828 nt12.8□□□□□ -0.36
GAL83Q04739 RPN10YHR200W 807 nt12.7□□□□□ -0.38
GAL83Q04739 SCR1SCR1 522 nt12.69□□□□□ -0.38
GAL83Q04739 PUN1YLR414C 792 nt12.59□□□□□ -0.39
GAL83Q04739 PTC2YER089C 1395 nt12.58□□□□□ -0.4
GAL83Q04739 YNL208WYNL208W 600 nt12.57□□□□□ -0.4
GAL83Q04739 ATS1YAL020C 1002 nt12.54□□□□□ -0.4
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GAL83Q04739 NAB2YGL122C 1578 nt12.48□□□□□ -0.41
GAL83Q04739 RRN5YLR141W 1092 nt12.44□□□□□ -0.42
GAL83Q04739 YJR018WYJR018W 363 nt12.4□□□□□ -0.42
GAL83Q04739 BDF1YLR399C 2061 nt12.35□□□□□ -0.43
GAL83Q04739 MEP2YNL142W 1500 nt12.34□□□□□ -0.43
GAL83Q04739 GAR1YHR089C 618 nt12.32□□□□□ -0.44
GAL83Q04739 FPR4YLR449W 1179 nt12.23□□□□□ -0.45
GAL83Q04739 FIS1YIL065C 468 nt12.21□□□□□ -0.45
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GAL83Q04739 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.19□□□□□ -0.46
GAL83Q04739 TAT1YBR069C 1860 nt12.17□□□□□ -0.46
GAL83Q04739 RSB1YOR049C 1065 nt12.14□□□□□ -0.47
GAL83Q04739 DCW1YKL046C 1350 nt12.14□□□□□ -0.47
GAL83Q04739 PHO4YFR034C 939 nt12.08□□□□□ -0.48
GAL83Q04739 YPS1YLR120C 1710 nt12.06□□□□□ -0.48
GAL83Q04739 INM2YDR287W 879 nt12.04□□□□□ -0.48
GAL83Q04739 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.04□□□□□ -0.48
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GAL83Q04739 EMI2YDR516C 1503 nt11.96□□□□□ -0.49
GAL83Q04739 YBR220CYBR220C 1683 nt11.94□□□□□ -0.5
GAL83Q04739 TIR1YER011W 765 nt11.91□□□□□ -0.5
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GAL83Q04739 YDR095CYDR095C 411 nt11.88□□□□□ -0.51
GAL83Q04739 YBL100CYBL100C 315 nt11.83□□□□□ -0.52
GAL83Q04739 YDL221WYDL221W 552 nt11.8□□□□□ -0.52
GAL83Q04739 SDH1YKL148C 1923 nt11.78□□□□□ -0.52
GAL83Q04739 CAC2YML102W 1407 nt11.73□□□□□ -0.53
GAL83Q04739 RPP2AYOL039W 321 nt11.68□□□□□ -0.54
GAL83Q04739 PTP1YDL230W 1008 nt11.67□□□□□ -0.54
GAL83Q04739 ALF1YNL148C 765 nt11.67□□□□□ -0.54
GAL83Q04739 PCH2YBR186W 1695 nt11.66□□□□□ -0.54
GAL83Q04739 FUN26YAL022C 1554 nt11.66□□□□□ -0.54
GAL83Q04739 PST2YDR032C 597 nt11.65□□□□□ -0.54
GAL83Q04739 SCC4YER147C 1875 nt11.63□□□□□ -0.55
GAL83Q04739 SEC11YIR022W 504 nt11.62□□□□□ -0.55
GAL83Q04739 GUT2YIL155C 1950 nt11.61□□□□□ -0.55
GAL83Q04739 BDH2YAL061W 1254 nt11.59□□□□□ -0.55
GAL83Q04739 SRB2YHR041C 633 nt11.55□□□□□ -0.56
GAL83Q04739 IRC15YPL017C 1500 nt11.55□□□□□ -0.56
GAL83Q04739 TRM9YML014W 840 nt11.53□□□□□ -0.56
GAL83Q04739 GIS3YLR094C 1509 nt11.5□□□□□ -0.57
GAL83Q04739 NVJ2YPR091C 2313 nt11.49□□□□□ -0.57
GAL83Q04739 YSC84YHR016C 1407 nt11.44□□□□□ -0.58
GAL83Q04739 SIS1YNL007C 1059 nt11.44□□□□□ -0.58
GAL83Q04739 CCT6YDR188W 1641 nt11.4□□□□□ -0.58
GAL83Q04739 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.39□□□□□ -0.59
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