Protein–RNA interactions for Protein: P53849

GIS2, Zinc finger protein GIS2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIS2P53849 YML009W-BYML009W-B 477 nt13.82□□□□□ -0.2 RIP-Chip
GIS2P53849 NOP1YDL014W 984 nt13.69□□□□□ -0.22 RIP-Chip
GIS2P53849 NSR1YGR159C 1245 nt13.41□□□□□ -0.26
GIS2P53849 YKL036CYKL036C 393 nt12.99□□□□□ -0.33
GIS2P53849 YJL027CYJL027C 417 nt12.19□□□□□ -0.46
GIS2P53849 Q0297Q0297 156 nt12.08□□□□□ -0.48
GIS2P53849 SCS3YGL126W 1143 nt11.99□□□□□ -0.49
GIS2P53849 MDJ1YFL016C 1536 nt11.94□□□□□ -0.5
GIS2P53849 SRX1YKL086W 384 nt11.92□□□□□ -0.5
GIS2P53849 YCR051WYCR051W 669 nt11.31□□□□□ -0.6 RIP-Chip
GIS2P53849 SCJ1YMR214W 1134 nt11.26□□□□□ -0.61 RIP-Chip
GIS2P53849 YOL085CYOL085C 342 nt11.19□□□□□ -0.62
GIS2P53849 PKP1YIL042C 1185 nt10.91□□□□□ -0.66
GIS2P53849 ATS1YAL020C 1002 nt10.85□□□□□ -0.67
GIS2P53849 RPP1BYDL130W 321 nt10.83□□□□□ -0.68
GIS2P53849 TRN1tP(UGG)A 72 nt10.51□□□□□ -0.73
GIS2P53849 SUF9tP(UGG)F 72 nt10.51□□□□□ -0.73
GIS2P53849 SUF8tP(UGG)H 72 nt10.51□□□□□ -0.73
GIS2P53849 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt10.51□□□□□ -0.73
GIS2P53849 SUF7tP(UGG)M 72 nt10.51□□□□□ -0.73
GIS2P53849 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt10.51□□□□□ -0.73
GIS2P53849 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt10.51□□□□□ -0.73
GIS2P53849 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt10.51□□□□□ -0.73
GIS2P53849 SUF11tP(UGG)O2 72 nt10.51□□□□□ -0.73
GIS2P53849 DBP2YNL112W 1641 nt10.47□□□□□ -0.73 RIP-Chip
GIS2P53849 CCC1YLR220W 969 nt10.36□□□□□ -0.75
GIS2P53849 SCR1SCR1 522 nt10.36□□□□□ -0.75
GIS2P53849 PET122YER153C 765 nt10.25□□□□□ -0.77
GIS2P53849 YBR190WYBR190W 312 nt10.25□□□□□ -0.77
GIS2P53849 RTC3YHR087W 336 nt10.15□□□□□ -0.78
GIS2P53849 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt10.07□□□□□ -0.8
GIS2P53849 RRN5YLR141W 1092 nt10□□□□□ -0.81
GIS2P53849 PST2YDR032C 597 nt9.97□□□□□ -0.81
GIS2P53849 RSB1YOR049C 1065 nt9.95□□□□□ -0.82
GIS2P53849 RVS167YDR388W 1449 nt9.89□□□□□ -0.83
GIS2P53849 YKL097CYKL097C 411 nt9.85□□□□□ -0.83
GIS2P53849 YER088W-BYER088W-B 147 nt9.81□□□□□ -0.84
GIS2P53849 YDJ1YNL064C 1230 nt9.79□□□□□ -0.84 RIP-Chip
GIS2P53849 SHR5YOL110W 714 nt9.59□□□□□ -0.87
GIS2P53849 SSA3YBL075C 1950 nt9.55□□□□□ -0.88
GIS2P53849 PUT4YOR348C 1884 nt9.53□□□□□ -0.88
GIS2P53849 GAR1YHR089C 618 nt9.44□□□□□ -0.9 RIP-Chip
GIS2P53849 SHU1YHL006C 453 nt9.43□□□□□ -0.9
GIS2P53849 YOR139CYOR139C 393 nt9.29□□□□□ -0.92
GIS2P53849 URN1YPR152C 1398 nt9.28□□□□□ -0.92 RIP-Chip
GIS2P53849 ARE1YCR048W 1833 nt9.28□□□□□ -0.92
GIS2P53849 POA1YBR022W 534 nt9.22□□□□□ -0.93
GIS2P53849 SAH1YER043C 1350 nt9.22□□□□□ -0.93
GIS2P53849 NPL3YDR432W 1245 nt9.2□□□□□ -0.94
GIS2P53849 DEP1YAL013W 1218 nt9.2□□□□□ -0.94 RIP-Chip
GIS2P53849 OPI9YLR338W 858 nt9.19□□□□□ -0.94
GIS2P53849 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt9.13□□□□□ -0.95
GIS2P53849 TIR1YER011W 765 nt9.12□□□□□ -0.95
GIS2P53849 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt9.1□□□□□ -0.95
GIS2P53849 YNL208WYNL208W 600 nt9.09□□□□□ -0.95 RIP-Chip
GIS2P53849 RPN10YHR200W 807 nt9.08□□□□□ -0.96
GIS2P53849 BSC6YOL137W 1494 nt9.05□□□□□ -0.96
GIS2P53849 YOL037CYOL037C 354 nt8.98□□□□□ -0.97
GIS2P53849 YGR021WYGR021W 873 nt8.95□□□□□ -0.98 RIP-Chip
GIS2P53849 PUN1YLR414C 792 nt8.92□□□□□ -0.98
GIS2P53849 BUD23YCR047C 828 nt8.91□□□□□ -0.98 RIP-Chip
GIS2P53849 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt8.91□□□□□ -0.98
GIS2P53849 IMT4tM(CAU)E 72 nt8.91□□□□□ -0.98
GIS2P53849 IMT3tM(CAU)J3 72 nt8.91□□□□□ -0.98
GIS2P53849 IMT1tM(CAU)O1 72 nt8.91□□□□□ -0.98
GIS2P53849 IMT2tM(CAU)P 72 nt8.91□□□□□ -0.98
GIS2P53849 SSA1YAL005C 1929 nt8.88□□□□□ -0.99
GIS2P53849 SPT5YML010W 3192 nt8.87□□□□□ -0.99 RIP-Chip
GIS2P53849 PTC2YER089C 1395 nt8.86□□□□□ -0.99
GIS2P53849 HOM6YJR139C 1080 nt8.86□□□□□ -0.99
GIS2P53849 YJR018WYJR018W 363 nt8.84□□□□□ -0.99
GIS2P53849 MNP1YGL068W 585 nt8.83□□□□□ -1
GIS2P53849 NAB2YGL122C 1578 nt8.79□□□□□ -1
GIS2P53849 MOT3YMR070W 1473 nt8.76□□□□□ -1.01
GIS2P53849 WWM1YFL010C 636 nt8.75□□□□□ -1.01
GIS2P53849 RKM5YLR137W 1104 nt8.74□□□□□ -1.01 RIP-Chip
GIS2P53849 SRB2YHR041C 633 nt8.72□□□□□ -1.01
GIS2P53849 PUS2YGL063W 1113 nt8.7□□□□□ -1.02
GIS2P53849 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt8.69□□□□□ -1.02
GIS2P53849 YLR281CYLR281C 468 nt8.67□□□□□ -1.02
GIS2P53849 RPP2BYDR382W 333 nt8.66□□□□□ -1.02
GIS2P53849 MRPL8YJL063C 717 nt8.66□□□□□ -1.02
GIS2P53849 SSA4YER103W 1929 nt8.64□□□□□ -1.03
GIS2P53849 YJR120WYJR120W 351 nt8.64□□□□□ -1.03
GIS2P53849 DAL1YIR027C 1383 nt8.61□□□□□ -1.03
GIS2P53849 FIS1YIL065C 468 nt8.61□□□□□ -1.03
GIS2P53849 FPR4YLR449W 1179 nt8.6□□□□□ -1.03 RIP-Chip
GIS2P53849 INM2YDR287W 879 nt8.56□□□□□ -1.04
GIS2P53849 WHI5YOR083W 888 nt8.56□□□□□ -1.04
GIS2P53849 MEP2YNL142W 1500 nt8.53□□□□□ -1.04
GIS2P53849 PHO4YFR034C 939 nt8.52□□□□□ -1.05 RIP-Chip
GIS2P53849 BDH2YAL061W 1254 nt8.52□□□□□ -1.05 RIP-Chip
GIS2P53849 LSM3YLR438C-A 270 nt8.51□□□□□ -1.05 RIP-Chip
GIS2P53849 IMP2'YIL154C 1041 nt8.5□□□□□ -1.05
GIS2P53849 ADO1YJR105W 1023 nt8.5□□□□□ -1.05
GIS2P53849 FMP45YDL222C 930 nt8.48□□□□□ -1.05
GIS2P53849 YPS1YLR120C 1710 nt8.47□□□□□ -1.05
GIS2P53849 YCH1YGR203W 447 nt8.47□□□□□ -1.05
GIS2P53849 DSK2YMR276W 1122 nt8.46□□□□□ -1.06
GIS2P53849 YBL100CYBL100C 315 nt8.41□□□□□ -1.06
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