Protein–RNA interactions for Protein: Q12259

YLR108C, BTB/POZ domain-containing protein YLR108C, yeastyeast

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR108CQ12259 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.3■□□□□ 0.36
YLR108CQ12259 NSR1YGR159C 1245 nt17.23■□□□□ 0.35
YLR108CQ12259 NOP1YDL014W 984 nt16.85■□□□□ 0.29
YLR108CQ12259 YKL036CYKL036C 393 nt15.56■□□□□ 0.08
YLR108CQ12259 MDJ1YFL016C 1536 nt15.44■□□□□ 0.06
YLR108CQ12259 Q0297Q0297 156 nt14.8□□□□□ -0.04
YLR108CQ12259 SRX1YKL086W 384 nt14.74□□□□□ -0.05
YLR108CQ12259 YJL027CYJL027C 417 nt14.51□□□□□ -0.09
YLR108CQ12259 SCS3YGL126W 1143 nt14.18□□□□□ -0.14
YLR108CQ12259 YCR051WYCR051W 669 nt13.93□□□□□ -0.18
YLR108CQ12259 SSA3YBL075C 1950 nt13.76□□□□□ -0.21
YLR108CQ12259 DBP2YNL112W 1641 nt13.56□□□□□ -0.24
YLR108CQ12259 YOL085CYOL085C 342 nt13.5□□□□□ -0.25
YLR108CQ12259 YBR190WYBR190W 312 nt13.36□□□□□ -0.27
YLR108CQ12259 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.33□□□□□ -0.28
YLR108CQ12259 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.33□□□□□ -0.28
YLR108CQ12259 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.33□□□□□ -0.28
YLR108CQ12259 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.33□□□□□ -0.28
YLR108CQ12259 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.33□□□□□ -0.28
YLR108CQ12259 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.33□□□□□ -0.28
YLR108CQ12259 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.33□□□□□ -0.28
YLR108CQ12259 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.33□□□□□ -0.28
YLR108CQ12259 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.33□□□□□ -0.28
YLR108CQ12259 RPP1BYDL130W 321 nt13.26□□□□□ -0.29
YLR108CQ12259 PKP1YIL042C 1185 nt13.24□□□□□ -0.29
YLR108CQ12259 CCC1YLR220W 969 nt13.13□□□□□ -0.31
YLR108CQ12259 RTC3YHR087W 336 nt13.03□□□□□ -0.32
YLR108CQ12259 PUT4YOR348C 1884 nt12.72□□□□□ -0.37
YLR108CQ12259 ATS1YAL020C 1002 nt12.7□□□□□ -0.38
YLR108CQ12259 RVS167YDR388W 1449 nt12.69□□□□□ -0.38
YLR108CQ12259 SCJ1YMR214W 1134 nt12.67□□□□□ -0.38
YLR108CQ12259 PET122YER153C 765 nt12.65□□□□□ -0.38
YLR108CQ12259 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.6□□□□□ -0.39
YLR108CQ12259 SCR1SCR1 522 nt12.5□□□□□ -0.41
YLR108CQ12259 RRN5YLR141W 1092 nt12.28□□□□□ -0.44
YLR108CQ12259 SHR5YOL110W 714 nt12.28□□□□□ -0.44
YLR108CQ12259 ARE1YCR048W 1833 nt12.26□□□□□ -0.45
YLR108CQ12259 POA1YBR022W 534 nt12.25□□□□□ -0.45
YLR108CQ12259 YDJ1YNL064C 1230 nt12.2□□□□□ -0.46
YLR108CQ12259 SPT5YML010W 3192 nt12.16□□□□□ -0.46
YLR108CQ12259 BSC6YOL137W 1494 nt12.14□□□□□ -0.47
YLR108CQ12259 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.11□□□□□ -0.47
YLR108CQ12259 SSA4YER103W 1929 nt12.09□□□□□ -0.47
YLR108CQ12259 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.06□□□□□ -0.48
YLR108CQ12259 SAH1YER043C 1350 nt12.02□□□□□ -0.49
YLR108CQ12259 RSB1YOR049C 1065 nt12.01□□□□□ -0.49
YLR108CQ12259 URN1YPR152C 1398 nt11.92□□□□□ -0.5
YLR108CQ12259 OPI9YLR338W 858 nt11.9□□□□□ -0.5
YLR108CQ12259 GAR1YHR089C 618 nt11.89□□□□□ -0.51
YLR108CQ12259 DEP1YAL013W 1218 nt11.88□□□□□ -0.51
YLR108CQ12259 PST2YDR032C 597 nt11.79□□□□□ -0.52
YLR108CQ12259 BUD23YCR047C 828 nt11.76□□□□□ -0.53
YLR108CQ12259 YNL208WYNL208W 600 nt11.73□□□□□ -0.53
YLR108CQ12259 BDF1YLR399C 2061 nt11.72□□□□□ -0.53
YLR108CQ12259 RPN10YHR200W 807 nt11.71□□□□□ -0.53
YLR108CQ12259 PUN1YLR414C 792 nt11.55□□□□□ -0.56
YLR108CQ12259 TAT1YBR069C 1860 nt11.55□□□□□ -0.56
YLR108CQ12259 PTC2YER089C 1395 nt11.54□□□□□ -0.56
YLR108CQ12259 TIR1YER011W 765 nt11.5□□□□□ -0.57
YLR108CQ12259 NAB2YGL122C 1578 nt11.5□□□□□ -0.57
YLR108CQ12259 MEP2YNL142W 1500 nt11.47□□□□□ -0.57
YLR108CQ12259 PAC11YDR488C 1602 nt11.44□□□□□ -0.58
YLR108CQ12259 SSA1YAL005C 1929 nt11.39□□□□□ -0.59
YLR108CQ12259 YJR018WYJR018W 363 nt11.36□□□□□ -0.59
YLR108CQ12259 SHU1YHL006C 453 nt11.28□□□□□ -0.6
YLR108CQ12259 YKL097CYKL097C 411 nt11.28□□□□□ -0.6
YLR108CQ12259 DCW1YKL046C 1350 nt11.28□□□□□ -0.6
YLR108CQ12259 FIS1YIL065C 468 nt11.26□□□□□ -0.61
YLR108CQ12259 YJR120WYJR120W 351 nt11.25□□□□□ -0.61
YLR108CQ12259 SRB2YHR041C 633 nt11.22□□□□□ -0.61
YLR108CQ12259 DAL1YIR027C 1383 nt11.19□□□□□ -0.62
YLR108CQ12259 YBR220CYBR220C 1683 nt11.16□□□□□ -0.62
YLR108CQ12259 YPS1YLR120C 1710 nt11.15□□□□□ -0.62
YLR108CQ12259 FPR4YLR449W 1179 nt11.15□□□□□ -0.62
YLR108CQ12259 NVJ2YPR091C 2313 nt11.11□□□□□ -0.63
YLR108CQ12259 RPP2BYDR382W 333 nt11.11□□□□□ -0.63
YLR108CQ12259 EMI2YDR516C 1503 nt11.1□□□□□ -0.63
YLR108CQ12259 PHO4YFR034C 939 nt11.1□□□□□ -0.63
YLR108CQ12259 YMR090WYMR090W 684 nt11.1□□□□□ -0.63
YLR108CQ12259 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.07□□□□□ -0.64
YLR108CQ12259 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.06□□□□□ -0.64
YLR108CQ12259 INM2YDR287W 879 nt11.01□□□□□ -0.65
YLR108CQ12259 WWM1YFL010C 636 nt11□□□□□ -0.65
YLR108CQ12259 SDH1YKL148C 1923 nt10.97□□□□□ -0.65
YLR108CQ12259 YDL221WYDL221W 552 nt10.96□□□□□ -0.65
YLR108CQ12259 YDR095CYDR095C 411 nt10.96□□□□□ -0.65
YLR108CQ12259 YGR021WYGR021W 873 nt10.95□□□□□ -0.66
YLR108CQ12259 HOM6YJR139C 1080 nt10.94□□□□□ -0.66
YLR108CQ12259 PCH2YBR186W 1695 nt10.94□□□□□ -0.66
YLR108CQ12259 BDH2YAL061W 1254 nt10.93□□□□□ -0.66
YLR108CQ12259 GUT2YIL155C 1950 nt10.91□□□□□ -0.66
YLR108CQ12259 SEC11YIR022W 504 nt10.87□□□□□ -0.67
YLR108CQ12259 YOR139CYOR139C 393 nt10.87□□□□□ -0.67
YLR108CQ12259 MNP1YGL068W 585 nt10.85□□□□□ -0.67
YLR108CQ12259 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.84□□□□□ -0.67
YLR108CQ12259 YBL100CYBL100C 315 nt10.84□□□□□ -0.67
YLR108CQ12259 CAC2YML102W 1407 nt10.84□□□□□ -0.67
YLR108CQ12259 LSM3YLR438C-A 270 nt10.81□□□□□ -0.68
YLR108CQ12259 SCC4YER147C 1875 nt10.79□□□□□ -0.68
YLR108CQ12259 PTP1YDL230W 1008 nt10.78□□□□□ -0.68
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