Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 NSR1YGR159C 1245 nt17.91■□□□□ 0.46
SSK1Q07084 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.6■□□□□ 0.41
SSK1Q07084 NOP1YDL014W 984 nt16.97■□□□□ 0.31
SSK1Q07084 MDJ1YFL016C 1536 nt16.23■□□□□ 0.19
SSK1Q07084 YKL036CYKL036C 393 nt15.55■□□□□ 0.08
SSK1Q07084 YJL027CYJL027C 417 nt14.9□□□□□ -0.02
SSK1Q07084 SRX1YKL086W 384 nt14.89□□□□□ -0.03
SSK1Q07084 Q0297Q0297 156 nt14.83□□□□□ -0.04
SSK1Q07084 DBP2YNL112W 1641 nt14.31□□□□□ -0.12
SSK1Q07084 SCS3YGL126W 1143 nt14.23□□□□□ -0.13
SSK1Q07084 YCR051WYCR051W 669 nt14.01□□□□□ -0.17
SSK1Q07084 YBR190WYBR190W 312 nt13.96□□□□□ -0.17
SSK1Q07084 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.7□□□□□ -0.22
SSK1Q07084 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.7□□□□□ -0.22
SSK1Q07084 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.7□□□□□ -0.22
SSK1Q07084 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.7□□□□□ -0.22
SSK1Q07084 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.7□□□□□ -0.22
SSK1Q07084 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.7□□□□□ -0.22
SSK1Q07084 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.7□□□□□ -0.22
SSK1Q07084 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.7□□□□□ -0.22
SSK1Q07084 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.7□□□□□ -0.22
SSK1Q07084 RTC3YHR087W 336 nt13.62□□□□□ -0.23
SSK1Q07084 YOL085CYOL085C 342 nt13.51□□□□□ -0.25
SSK1Q07084 CCC1YLR220W 969 nt13.45□□□□□ -0.26
SSK1Q07084 SSA3YBL075C 1950 nt13.41□□□□□ -0.26
SSK1Q07084 PKP1YIL042C 1185 nt13.28□□□□□ -0.28
SSK1Q07084 RPP1BYDL130W 321 nt13.27□□□□□ -0.29
SSK1Q07084 RVS167YDR388W 1449 nt13.2□□□□□ -0.3
SSK1Q07084 SCJ1YMR214W 1134 nt13.17□□□□□ -0.3
SSK1Q07084 PUT4YOR348C 1884 nt13.02□□□□□ -0.32
SSK1Q07084 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.82□□□□□ -0.36
SSK1Q07084 ATS1YAL020C 1002 nt12.73□□□□□ -0.37
SSK1Q07084 PET122YER153C 765 nt12.72□□□□□ -0.37
SSK1Q07084 SHR5YOL110W 714 nt12.72□□□□□ -0.37
SSK1Q07084 ARE1YCR048W 1833 nt12.66□□□□□ -0.38
SSK1Q07084 URN1YPR152C 1398 nt12.57□□□□□ -0.4
SSK1Q07084 POA1YBR022W 534 nt12.56□□□□□ -0.4
SSK1Q07084 OPI9YLR338W 858 nt12.52□□□□□ -0.41
SSK1Q07084 SAH1YER043C 1350 nt12.52□□□□□ -0.41
SSK1Q07084 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.49□□□□□ -0.41
SSK1Q07084 SCR1SCR1 522 nt12.45□□□□□ -0.42
SSK1Q07084 DEP1YAL013W 1218 nt12.43□□□□□ -0.42
SSK1Q07084 YDJ1YNL064C 1230 nt12.43□□□□□ -0.42
SSK1Q07084 BSC6YOL137W 1494 nt12.39□□□□□ -0.43
SSK1Q07084 RRN5YLR141W 1092 nt12.31□□□□□ -0.44
SSK1Q07084 RPN10YHR200W 807 nt12.25□□□□□ -0.45
SSK1Q07084 SPT5YML010W 3192 nt12.24□□□□□ -0.45
SSK1Q07084 YNL208WYNL208W 600 nt12.23□□□□□ -0.45
SSK1Q07084 BUD23YCR047C 828 nt12.19□□□□□ -0.46
SSK1Q07084 GAR1YHR089C 618 nt12.13□□□□□ -0.47
SSK1Q07084 PUN1YLR414C 792 nt12.11□□□□□ -0.47
SSK1Q07084 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.08□□□□□ -0.48
SSK1Q07084 PTC2YER089C 1395 nt12.03□□□□□ -0.48
SSK1Q07084 RSB1YOR049C 1065 nt12□□□□□ -0.49
SSK1Q07084 SSA4YER103W 1929 nt11.98□□□□□ -0.49
SSK1Q07084 YJR018WYJR018W 363 nt11.98□□□□□ -0.49
SSK1Q07084 NAB2YGL122C 1578 nt11.93□□□□□ -0.5
SSK1Q07084 YJR120WYJR120W 351 nt11.85□□□□□ -0.51
SSK1Q07084 PST2YDR032C 597 nt11.81□□□□□ -0.52
SSK1Q07084 TIR1YER011W 765 nt11.78□□□□□ -0.52
SSK1Q07084 FIS1YIL065C 468 nt11.78□□□□□ -0.52
SSK1Q07084 SSA1YAL005C 1929 nt11.76□□□□□ -0.53
SSK1Q07084 DAL1YIR027C 1383 nt11.7□□□□□ -0.54
SSK1Q07084 FPR4YLR449W 1179 nt11.69□□□□□ -0.54
SSK1Q07084 MEP2YNL142W 1500 nt11.66□□□□□ -0.54
SSK1Q07084 INM2YDR287W 879 nt11.61□□□□□ -0.55
SSK1Q07084 PHO4YFR034C 939 nt11.6□□□□□ -0.55
SSK1Q07084 RPP2BYDR382W 333 nt11.57□□□□□ -0.56
SSK1Q07084 SRB2YHR041C 633 nt11.56□□□□□ -0.56
SSK1Q07084 YPS1YLR120C 1710 nt11.55□□□□□ -0.56
SSK1Q07084 BDF1YLR399C 2061 nt11.52□□□□□ -0.57
SSK1Q07084 DCW1YKL046C 1350 nt11.48□□□□□ -0.57
SSK1Q07084 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.47□□□□□ -0.57
SSK1Q07084 YDR095CYDR095C 411 nt11.42□□□□□ -0.58
SSK1Q07084 YBL100CYBL100C 315 nt11.42□□□□□ -0.58
SSK1Q07084 TAT1YBR069C 1860 nt11.38□□□□□ -0.59
SSK1Q07084 BDH2YAL061W 1254 nt11.36□□□□□ -0.59
SSK1Q07084 EMI2YDR516C 1503 nt11.32□□□□□ -0.6
SSK1Q07084 SHU1YHL006C 453 nt11.32□□□□□ -0.6
SSK1Q07084 YMR090WYMR090W 684 nt11.32□□□□□ -0.6
SSK1Q07084 YKL097CYKL097C 411 nt11.31□□□□□ -0.6
SSK1Q07084 FUN26YAL022C 1554 nt11.29□□□□□ -0.6
SSK1Q07084 PTP1YDL230W 1008 nt11.26□□□□□ -0.61
SSK1Q07084 PAC11YDR488C 1602 nt11.25□□□□□ -0.61
SSK1Q07084 YBR220CYBR220C 1683 nt11.25□□□□□ -0.61
SSK1Q07084 CAC2YML102W 1407 nt11.2□□□□□ -0.62
SSK1Q07084 WWM1YFL010C 636 nt11.2□□□□□ -0.62
SSK1Q07084 ALF1YNL148C 765 nt11.2□□□□□ -0.62
SSK1Q07084 YDL221WYDL221W 552 nt11.19□□□□□ -0.62
SSK1Q07084 RPP2AYOL039W 321 nt11.18□□□□□ -0.62
SSK1Q07084 LSM3YLR438C-A 270 nt11.16□□□□□ -0.62
SSK1Q07084 TRM9YML014W 840 nt11.16□□□□□ -0.62
SSK1Q07084 SDH1YKL148C 1923 nt11.15□□□□□ -0.62
SSK1Q07084 CCT6YDR188W 1641 nt11.14□□□□□ -0.63
SSK1Q07084 SIS1YNL007C 1059 nt11.11□□□□□ -0.63
SSK1Q07084 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.1□□□□□ -0.63
SSK1Q07084 NVJ2YPR091C 2313 nt11.07□□□□□ -0.64
SSK1Q07084 IRC15YPL017C 1500 nt11.05□□□□□ -0.64
SSK1Q07084 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.03□□□□□ -0.64
SSK1Q07084 Q0182Q0182 405 nt11.02□□□□□ -0.65
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