Protein–RNA interactions for Protein: P47040

YHC3, Protein BTN1, yeastyeast

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC3P47040 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.06■□□□□ 0.32
YHC3P47040 NSR1YGR159C 1245 nt16.92■□□□□ 0.3
YHC3P47040 NOP1YDL014W 984 nt16.75■□□□□ 0.27
YHC3P47040 YKL036CYKL036C 393 nt15.55■□□□□ 0.08
YHC3P47040 MDJ1YFL016C 1536 nt15.51■□□□□ 0.07
YHC3P47040 Q0297Q0297 156 nt14.69□□□□□ -0.06
YHC3P47040 SRX1YKL086W 384 nt14.6□□□□□ -0.07
YHC3P47040 YJL027CYJL027C 417 nt14.5□□□□□ -0.09
YHC3P47040 SCS3YGL126W 1143 nt14.16□□□□□ -0.14
YHC3P47040 YCR051WYCR051W 669 nt13.8□□□□□ -0.2
YHC3P47040 DBP2YNL112W 1641 nt13.55□□□□□ -0.24
YHC3P47040 YOL085CYOL085C 342 nt13.43□□□□□ -0.26
YHC3P47040 YBR190WYBR190W 312 nt13.38□□□□□ -0.27
YHC3P47040 SSA3YBL075C 1950 nt13.31□□□□□ -0.28
YHC3P47040 RPP1BYDL130W 321 nt13.17□□□□□ -0.3
YHC3P47040 PKP1YIL042C 1185 nt13.12□□□□□ -0.31
YHC3P47040 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.09□□□□□ -0.31
YHC3P47040 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.09□□□□□ -0.31
YHC3P47040 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.09□□□□□ -0.31
YHC3P47040 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.09□□□□□ -0.31
YHC3P47040 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.09□□□□□ -0.31
YHC3P47040 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.09□□□□□ -0.31
YHC3P47040 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.09□□□□□ -0.31
YHC3P47040 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.09□□□□□ -0.31
YHC3P47040 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.09□□□□□ -0.31
YHC3P47040 RTC3YHR087W 336 nt12.99□□□□□ -0.33
YHC3P47040 CCC1YLR220W 969 nt12.88□□□□□ -0.35
YHC3P47040 SCJ1YMR214W 1134 nt12.87□□□□□ -0.35
YHC3P47040 ATS1YAL020C 1002 nt12.73□□□□□ -0.37
YHC3P47040 PUT4YOR348C 1884 nt12.65□□□□□ -0.38
YHC3P47040 PET122YER153C 765 nt12.5□□□□□ -0.41
YHC3P47040 SCR1SCR1 522 nt12.49□□□□□ -0.41
YHC3P47040 RVS167YDR388W 1449 nt12.48□□□□□ -0.41
YHC3P47040 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.43□□□□□ -0.42
YHC3P47040 ARE1YCR048W 1833 nt12.24□□□□□ -0.45
YHC3P47040 POA1YBR022W 534 nt12.17□□□□□ -0.46
YHC3P47040 RRN5YLR141W 1092 nt12.16□□□□□ -0.46
YHC3P47040 YDJ1YNL064C 1230 nt12.09□□□□□ -0.47
YHC3P47040 SHR5YOL110W 714 nt12.07□□□□□ -0.48
YHC3P47040 SPT5YML010W 3192 nt12.06□□□□□ -0.48
YHC3P47040 SAH1YER043C 1350 nt12.04□□□□□ -0.48
YHC3P47040 BSC6YOL137W 1494 nt12.02□□□□□ -0.48
YHC3P47040 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.02□□□□□ -0.49
YHC3P47040 URN1YPR152C 1398 nt11.98□□□□□ -0.49
YHC3P47040 OPI9YLR338W 858 nt11.96□□□□□ -0.49
YHC3P47040 RSB1YOR049C 1065 nt11.95□□□□□ -0.5
YHC3P47040 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.93□□□□□ -0.5
YHC3P47040 SSA4YER103W 1929 nt11.83□□□□□ -0.52
YHC3P47040 DEP1YAL013W 1218 nt11.81□□□□□ -0.52
YHC3P47040 PST2YDR032C 597 nt11.77□□□□□ -0.53
YHC3P47040 Q0182Q0182 405 nt11.69□□□□□ -0.54
YHC3P47040 GAR1YHR089C 618 nt11.68□□□□□ -0.54
YHC3P47040 BUD23YCR047C 828 nt11.67□□□□□ -0.54
YHC3P47040 RPN10YHR200W 807 nt11.6□□□□□ -0.55
YHC3P47040 PUN1YLR414C 792 nt11.55□□□□□ -0.56
YHC3P47040 PTC2YER089C 1395 nt11.54□□□□□ -0.56
YHC3P47040 YNL208WYNL208W 600 nt11.54□□□□□ -0.56
YHC3P47040 BDF1YLR399C 2061 nt11.5□□□□□ -0.57
YHC3P47040 NAB2YGL122C 1578 nt11.47□□□□□ -0.57
YHC3P47040 YJR018WYJR018W 363 nt11.39□□□□□ -0.59
YHC3P47040 YKL097CYKL097C 411 nt11.39□□□□□ -0.59
YHC3P47040 MEP2YNL142W 1500 nt11.37□□□□□ -0.59
YHC3P47040 TIR1YER011W 765 nt11.33□□□□□ -0.6
YHC3P47040 TAT1YBR069C 1860 nt11.3□□□□□ -0.6
YHC3P47040 FIS1YIL065C 468 nt11.29□□□□□ -0.6
YHC3P47040 SHU1YHL006C 453 nt11.22□□□□□ -0.61
YHC3P47040 DAL1YIR027C 1383 nt11.2□□□□□ -0.62
YHC3P47040 DCW1YKL046C 1350 nt11.19□□□□□ -0.62
YHC3P47040 YJR120WYJR120W 351 nt11.18□□□□□ -0.62
YHC3P47040 YPS1YLR120C 1710 nt11.13□□□□□ -0.63
YHC3P47040 SSA1YAL005C 1929 nt11.11□□□□□ -0.63
YHC3P47040 PHO4YFR034C 939 nt11.11□□□□□ -0.63
YHC3P47040 FPR4YLR449W 1179 nt11.11□□□□□ -0.63
YHC3P47040 INM2YDR287W 879 nt11.05□□□□□ -0.64
YHC3P47040 YBR220CYBR220C 1683 nt11.04□□□□□ -0.64
YHC3P47040 EMI2YDR516C 1503 nt10.99□□□□□ -0.65
YHC3P47040 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.98□□□□□ -0.65
YHC3P47040 PAC11YDR488C 1602 nt10.95□□□□□ -0.66
YHC3P47040 YDR095CYDR095C 411 nt10.95□□□□□ -0.66
YHC3P47040 RPP2BYDR382W 333 nt10.95□□□□□ -0.66
YHC3P47040 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.93□□□□□ -0.66
YHC3P47040 YGR021WYGR021W 873 nt10.91□□□□□ -0.66
YHC3P47040 YMR090WYMR090W 684 nt10.9□□□□□ -0.66
YHC3P47040 SRB2YHR041C 633 nt10.88□□□□□ -0.67
YHC3P47040 YDL221WYDL221W 552 nt10.87□□□□□ -0.67
YHC3P47040 SDH1YKL148C 1923 nt10.86□□□□□ -0.67
YHC3P47040 YOR139CYOR139C 393 nt10.86□□□□□ -0.67
YHC3P47040 CAC2YML102W 1407 nt10.85□□□□□ -0.67
YHC3P47040 PTP1YDL230W 1008 nt10.84□□□□□ -0.67
YHC3P47040 YBL100CYBL100C 315 nt10.84□□□□□ -0.67
YHC3P47040 MOT3YMR070W 1473 nt10.83□□□□□ -0.68
YHC3P47040 WWM1YFL010C 636 nt10.81□□□□□ -0.68
YHC3P47040 HOM6YJR139C 1080 nt10.81□□□□□ -0.68
YHC3P47040 NPL3YDR432W 1245 nt10.78□□□□□ -0.68
YHC3P47040 PCH2YBR186W 1695 nt10.75□□□□□ -0.69
YHC3P47040 BDH2YAL061W 1254 nt10.74□□□□□ -0.69
YHC3P47040 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.73□□□□□ -0.69
YHC3P47040 RPP2AYOL039W 321 nt10.73□□□□□ -0.69
YHC3P47040 GUT2YIL155C 1950 nt10.73□□□□□ -0.69
YHC3P47040 YOL037CYOL037C 354 nt10.72□□□□□ -0.69
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