Protein–RNA interactions for Protein: P08456

CHO1, CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase, yeastyeast

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CHO1P08456 NSR1YGR159C 1245 nt17.54■□□□□ 0.4
CHO1P08456 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.37■□□□□ 0.37
CHO1P08456 NOP1YDL014W 984 nt16.71■□□□□ 0.27
CHO1P08456 MDJ1YFL016C 1536 nt15.99■□□□□ 0.15
CHO1P08456 YKL036CYKL036C 393 nt15.03■□□□□ -0
CHO1P08456 YJL027CYJL027C 417 nt14.73□□□□□ -0.05
CHO1P08456 SRX1YKL086W 384 nt14.55□□□□□ -0.08
CHO1P08456 Q0297Q0297 156 nt14.44□□□□□ -0.1
CHO1P08456 DBP2YNL112W 1641 nt13.91□□□□□ -0.18
CHO1P08456 YCR051WYCR051W 669 nt13.84□□□□□ -0.19
CHO1P08456 YBR190WYBR190W 312 nt13.7□□□□□ -0.22
CHO1P08456 SCS3YGL126W 1143 nt13.46□□□□□ -0.25
CHO1P08456 RTC3YHR087W 336 nt13.46□□□□□ -0.25
CHO1P08456 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.39□□□□□ -0.27
CHO1P08456 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.39□□□□□ -0.27
CHO1P08456 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.39□□□□□ -0.27
CHO1P08456 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.39□□□□□ -0.27
CHO1P08456 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.39□□□□□ -0.27
CHO1P08456 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.39□□□□□ -0.27
CHO1P08456 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.39□□□□□ -0.27
CHO1P08456 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.39□□□□□ -0.27
CHO1P08456 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.39□□□□□ -0.27
CHO1P08456 CCC1YLR220W 969 nt13.33□□□□□ -0.28
CHO1P08456 RVS167YDR388W 1449 nt13.1□□□□□ -0.31
CHO1P08456 YOL085CYOL085C 342 nt13.01□□□□□ -0.33
CHO1P08456 RPP1BYDL130W 321 nt12.98□□□□□ -0.33
CHO1P08456 PKP1YIL042C 1185 nt12.9□□□□□ -0.34
CHO1P08456 SCJ1YMR214W 1134 nt12.89□□□□□ -0.35
CHO1P08456 SSA3YBL075C 1950 nt12.81□□□□□ -0.36
CHO1P08456 PUT4YOR348C 1884 nt12.72□□□□□ -0.37
CHO1P08456 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.55□□□□□ -0.4
CHO1P08456 SHR5YOL110W 714 nt12.51□□□□□ -0.41
CHO1P08456 PET122YER153C 765 nt12.46□□□□□ -0.41
CHO1P08456 URN1YPR152C 1398 nt12.42□□□□□ -0.42
CHO1P08456 ARE1YCR048W 1833 nt12.38□□□□□ -0.43
CHO1P08456 POA1YBR022W 534 nt12.34□□□□□ -0.43
CHO1P08456 SAH1YER043C 1350 nt12.33□□□□□ -0.44
CHO1P08456 DEP1YAL013W 1218 nt12.32□□□□□ -0.44
CHO1P08456 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.28□□□□□ -0.44
CHO1P08456 OPI9YLR338W 858 nt12.28□□□□□ -0.44
CHO1P08456 SCR1SCR1 522 nt12.25□□□□□ -0.45
CHO1P08456 RPN10YHR200W 807 nt12.17□□□□□ -0.46
CHO1P08456 BSC6YOL137W 1494 nt12.14□□□□□ -0.47
CHO1P08456 YDJ1YNL064C 1230 nt12.12□□□□□ -0.47
CHO1P08456 YNL208WYNL208W 600 nt12.06□□□□□ -0.48
CHO1P08456 RRN5YLR141W 1092 nt12.05□□□□□ -0.48
CHO1P08456 BUD23YCR047C 828 nt11.99□□□□□ -0.49
CHO1P08456 GAR1YHR089C 618 nt11.97□□□□□ -0.49
CHO1P08456 PUN1YLR414C 792 nt11.94□□□□□ -0.5
CHO1P08456 ATS1YAL020C 1002 nt11.92□□□□□ -0.5
CHO1P08456 PTC2YER089C 1395 nt11.88□□□□□ -0.51
CHO1P08456 YJR018WYJR018W 363 nt11.81□□□□□ -0.52
CHO1P08456 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.8□□□□□ -0.52
CHO1P08456 NAB2YGL122C 1578 nt11.76□□□□□ -0.53
CHO1P08456 SPT5YML010W 3192 nt11.74□□□□□ -0.53
CHO1P08456 RSB1YOR049C 1065 nt11.73□□□□□ -0.53
CHO1P08456 SSA4YER103W 1929 nt11.59□□□□□ -0.55
CHO1P08456 FPR4YLR449W 1179 nt11.57□□□□□ -0.56
CHO1P08456 TIR1YER011W 765 nt11.56□□□□□ -0.56
CHO1P08456 FIS1YIL065C 468 nt11.55□□□□□ -0.56
CHO1P08456 DAL1YIR027C 1383 nt11.54□□□□□ -0.56
CHO1P08456 RPP2BYDR382W 333 nt11.5□□□□□ -0.57
CHO1P08456 SSA1YAL005C 1929 nt11.48□□□□□ -0.57
CHO1P08456 YJR120WYJR120W 351 nt11.47□□□□□ -0.57
CHO1P08456 INM2YDR287W 879 nt11.43□□□□□ -0.58
CHO1P08456 PHO4YFR034C 939 nt11.43□□□□□ -0.58
CHO1P08456 MEP2YNL142W 1500 nt11.42□□□□□ -0.58
CHO1P08456 Q0182Q0182 405 nt11.34□□□□□ -0.59
CHO1P08456 YPS1YLR120C 1710 nt11.32□□□□□ -0.6
CHO1P08456 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.28□□□□□ -0.6
CHO1P08456 YBL100CYBL100C 315 nt11.28□□□□□ -0.6
CHO1P08456 DCW1YKL046C 1350 nt11.24□□□□□ -0.61
CHO1P08456 SRB2YHR041C 633 nt11.2□□□□□ -0.62
CHO1P08456 YDR095CYDR095C 411 nt11.18□□□□□ -0.62
CHO1P08456 BDH2YAL061W 1254 nt11.15□□□□□ -0.62
CHO1P08456 BDF1YLR399C 2061 nt11.13□□□□□ -0.63
CHO1P08456 FUN26YAL022C 1554 nt11.12□□□□□ -0.63
CHO1P08456 ALF1YNL148C 765 nt11.09□□□□□ -0.63
CHO1P08456 EMI2YDR516C 1503 nt11.09□□□□□ -0.63
CHO1P08456 PST2YDR032C 597 nt11.08□□□□□ -0.64
CHO1P08456 YMR090WYMR090W 684 nt11.08□□□□□ -0.64
CHO1P08456 TRM9YML014W 840 nt11.04□□□□□ -0.64
CHO1P08456 MOT3YMR070W 1473 nt11.01□□□□□ -0.65
CHO1P08456 WWM1YFL010C 636 nt10.99□□□□□ -0.65
CHO1P08456 RPP2AYOL039W 321 nt10.99□□□□□ -0.65
CHO1P08456 TAT1YBR069C 1860 nt10.99□□□□□ -0.65
CHO1P08456 YBR220CYBR220C 1683 nt10.98□□□□□ -0.65
CHO1P08456 YDL221WYDL221W 552 nt10.97□□□□□ -0.65
CHO1P08456 CAC2YML102W 1407 nt10.94□□□□□ -0.66
CHO1P08456 PTP1YDL230W 1008 nt10.94□□□□□ -0.66
CHO1P08456 LSM3YLR438C-A 270 nt10.92□□□□□ -0.66
CHO1P08456 CCT6YDR188W 1641 nt10.91□□□□□ -0.66
CHO1P08456 SDH1YKL148C 1923 nt10.9□□□□□ -0.67
CHO1P08456 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.89□□□□□ -0.67
CHO1P08456 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.89□□□□□ -0.67
CHO1P08456 SIS1YNL007C 1059 nt10.84□□□□□ -0.67
CHO1P08456 YGR021WYGR021W 873 nt10.82□□□□□ -0.68
CHO1P08456 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.81□□□□□ -0.68
CHO1P08456 SCC4YER147C 1875 nt10.8□□□□□ -0.68
CHO1P08456 IRC15YPL017C 1500 nt10.78□□□□□ -0.68
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