Protein–RNA interactions for Protein: Q04299

YMR087W, Probable ADP-ribose 1''-phosphate phosphatase YML087W, yeastyeast

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR087WQ04299 NSR1YGR159C 1245 nt18.4■□□□□ 0.54
YMR087WQ04299 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.16■□□□□ 0.5
YMR087WQ04299 NOP1YDL014W 984 nt17.48■□□□□ 0.39
YMR087WQ04299 MDJ1YFL016C 1536 nt16.75■□□□□ 0.27
YMR087WQ04299 YKL036CYKL036C 393 nt15.73■□□□□ 0.11
YMR087WQ04299 YJL027CYJL027C 417 nt15.41■□□□□ 0.06
YMR087WQ04299 SRX1YKL086W 384 nt15.27■□□□□ 0.04
YMR087WQ04299 Q0297Q0297 156 nt15.16■□□□□ 0.02
YMR087WQ04299 DBP2YNL112W 1641 nt14.64□□□□□ -0.07
YMR087WQ04299 YCR051WYCR051W 669 nt14.45□□□□□ -0.1
YMR087WQ04299 YBR190WYBR190W 312 nt14.39□□□□□ -0.11
YMR087WQ04299 SCS3YGL126W 1143 nt14.11□□□□□ -0.15
YMR087WQ04299 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.07□□□□□ -0.16
YMR087WQ04299 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.07□□□□□ -0.16
YMR087WQ04299 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.07□□□□□ -0.16
YMR087WQ04299 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.07□□□□□ -0.16
YMR087WQ04299 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.07□□□□□ -0.16
YMR087WQ04299 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.07□□□□□ -0.16
YMR087WQ04299 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.07□□□□□ -0.16
YMR087WQ04299 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.07□□□□□ -0.16
YMR087WQ04299 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.07□□□□□ -0.16
YMR087WQ04299 RTC3YHR087W 336 nt14.03□□□□□ -0.16
YMR087WQ04299 CCC1YLR220W 969 nt13.89□□□□□ -0.19
YMR087WQ04299 RVS167YDR388W 1449 nt13.68□□□□□ -0.22
YMR087WQ04299 YOL085CYOL085C 342 nt13.63□□□□□ -0.23
YMR087WQ04299 RPP1BYDL130W 321 nt13.6□□□□□ -0.23
YMR087WQ04299 SCJ1YMR214W 1134 nt13.54□□□□□ -0.24
YMR087WQ04299 SSA3YBL075C 1950 nt13.51□□□□□ -0.25
YMR087WQ04299 PKP1YIL042C 1185 nt13.47□□□□□ -0.25
YMR087WQ04299 PUT4YOR348C 1884 nt13.39□□□□□ -0.27
YMR087WQ04299 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.16□□□□□ -0.3
YMR087WQ04299 SHR5YOL110W 714 nt13.11□□□□□ -0.31
YMR087WQ04299 PET122YER153C 765 nt13.06□□□□□ -0.32
YMR087WQ04299 ARE1YCR048W 1833 nt13.02□□□□□ -0.33
YMR087WQ04299 URN1YPR152C 1398 nt12.99□□□□□ -0.33
YMR087WQ04299 POA1YBR022W 534 nt12.91□□□□□ -0.34
YMR087WQ04299 SAH1YER043C 1350 nt12.91□□□□□ -0.34
YMR087WQ04299 OPI9YLR338W 858 nt12.89□□□□□ -0.35
YMR087WQ04299 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.87□□□□□ -0.35
YMR087WQ04299 DEP1YAL013W 1218 nt12.86□□□□□ -0.35
YMR087WQ04299 SCR1SCR1 522 nt12.79□□□□□ -0.36
YMR087WQ04299 BSC6YOL137W 1494 nt12.74□□□□□ -0.37
YMR087WQ04299 YDJ1YNL064C 1230 nt12.74□□□□□ -0.37
YMR087WQ04299 RPN10YHR200W 807 nt12.72□□□□□ -0.37
YMR087WQ04299 YNL208WYNL208W 600 nt12.62□□□□□ -0.39
YMR087WQ04299 RRN5YLR141W 1092 nt12.61□□□□□ -0.39
YMR087WQ04299 BUD23YCR047C 828 nt12.52□□□□□ -0.41
YMR087WQ04299 PUN1YLR414C 792 nt12.52□□□□□ -0.41
YMR087WQ04299 GAR1YHR089C 618 nt12.51□□□□□ -0.41
YMR087WQ04299 ATS1YAL020C 1002 nt12.48□□□□□ -0.41
YMR087WQ04299 SPT5YML010W 3192 nt12.44□□□□□ -0.42
YMR087WQ04299 PTC2YER089C 1395 nt12.43□□□□□ -0.42
YMR087WQ04299 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.37□□□□□ -0.43
YMR087WQ04299 YJR018WYJR018W 363 nt12.36□□□□□ -0.43
YMR087WQ04299 NAB2YGL122C 1578 nt12.33□□□□□ -0.44
YMR087WQ04299 RSB1YOR049C 1065 nt12.24□□□□□ -0.45
YMR087WQ04299 SSA4YER103W 1929 nt12.21□□□□□ -0.46
YMR087WQ04299 FIS1YIL065C 468 nt12.14□□□□□ -0.47
YMR087WQ04299 TIR1YER011W 765 nt12.11□□□□□ -0.47
YMR087WQ04299 YJR120WYJR120W 351 nt12.1□□□□□ -0.47
YMR087WQ04299 DAL1YIR027C 1383 nt12.09□□□□□ -0.47
YMR087WQ04299 SSA1YAL005C 1929 nt12.05□□□□□ -0.48
YMR087WQ04299 FPR4YLR449W 1179 nt12.04□□□□□ -0.48
YMR087WQ04299 RPP2BYDR382W 333 nt12.01□□□□□ -0.49
YMR087WQ04299 MEP2YNL142W 1500 nt12□□□□□ -0.49
YMR087WQ04299 PHO4YFR034C 939 nt11.99□□□□□ -0.49
YMR087WQ04299 INM2YDR287W 879 nt11.97□□□□□ -0.49
YMR087WQ04299 YPS1YLR120C 1710 nt11.89□□□□□ -0.51
YMR087WQ04299 YBL100CYBL100C 315 nt11.81□□□□□ -0.52
YMR087WQ04299 DCW1YKL046C 1350 nt11.79□□□□□ -0.52
YMR087WQ04299 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.79□□□□□ -0.52
YMR087WQ04299 YDR095CYDR095C 411 nt11.77□□□□□ -0.53
YMR087WQ04299 SRB2YHR041C 633 nt11.77□□□□□ -0.53
YMR087WQ04299 BDF1YLR399C 2061 nt11.77□□□□□ -0.53
YMR087WQ04299 BDH2YAL061W 1254 nt11.7□□□□□ -0.54
YMR087WQ04299 FUN26YAL022C 1554 nt11.65□□□□□ -0.54
YMR087WQ04299 EMI2YDR516C 1503 nt11.64□□□□□ -0.55
YMR087WQ04299 TAT1YBR069C 1860 nt11.62□□□□□ -0.55
YMR087WQ04299 PST2YDR032C 597 nt11.62□□□□□ -0.55
YMR087WQ04299 YMR090WYMR090W 684 nt11.59□□□□□ -0.55
YMR087WQ04299 ALF1YNL148C 765 nt11.57□□□□□ -0.56
YMR087WQ04299 YBR220CYBR220C 1683 nt11.55□□□□□ -0.56
YMR087WQ04299 YDL221WYDL221W 552 nt11.53□□□□□ -0.56
YMR087WQ04299 TRM9YML014W 840 nt11.53□□□□□ -0.56
YMR087WQ04299 RPP2AYOL039W 321 nt11.53□□□□□ -0.56
YMR087WQ04299 PTP1YDL230W 1008 nt11.52□□□□□ -0.57
YMR087WQ04299 WWM1YFL010C 636 nt11.51□□□□□ -0.57
YMR087WQ04299 CAC2YML102W 1407 nt11.5□□□□□ -0.57
YMR087WQ04299 CCT6YDR188W 1641 nt11.46□□□□□ -0.57
YMR087WQ04299 SDH1YKL148C 1923 nt11.46□□□□□ -0.58
YMR087WQ04299 LSM3YLR438C-A 270 nt11.45□□□□□ -0.58
YMR087WQ04299 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.39□□□□□ -0.59
YMR087WQ04299 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.39□□□□□ -0.59
YMR087WQ04299 SIS1YNL007C 1059 nt11.39□□□□□ -0.59
YMR087WQ04299 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.35□□□□□ -0.59
YMR087WQ04299 YGR021WYGR021W 873 nt11.34□□□□□ -0.59
YMR087WQ04299 IRC15YPL017C 1500 nt11.34□□□□□ -0.59
YMR087WQ04299 SCC4YER147C 1875 nt11.33□□□□□ -0.6
YMR087WQ04299 GFD2YCL036W 1701 nt11.26□□□□□ -0.61
YMR087WQ04299 GIS3YLR094C 1509 nt11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.1 ms